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- 2019-06-01 发布于江苏
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PCR以及qPCR
PCR仪和荧光定量PCR仪
;目录;
;Temperature;模板(DNA or RNA)
引??(一对或多对)
脱氧核糖核苷酸 (dNTP原料)
热稳定的DNA聚合酶
Buffer (缓冲液提供适合的酶作用环境)
反应体系:5 - 50ul (常用)
;上样;PCR的基本原理;PCR的基本原理;PCR的基本原理;
PCR是当今应用最广泛的生物技术之一
为下游的研究提供原料:
测序
基因芯片
转基因
STR分析(亲子鉴定, 罪犯DNA文库建立, 分子考古)
噬菌体文库
……………
生物系统学,分类学,种质鉴定(SSR)
器官移植, 骨髓移植,干细胞移植配型
非常完美
;定性分析:
基因表达分析
基因分型( 甲基化, SNP)
传染病检测
食品检验(致病菌,病毒,转基因,食材源性)
…………
荧光定量PCR可取代,更简单,更精确
;Piko 系列快速PCR仪;
总结:
小
快
省钱
自动化(电动热盖)
;
问题1:快的原因?
a、升降温速度快(3块半导体,功率大)
b、95度1s内就能达到温度均一稳定(体积小,蜂巢式设计)
问题2:为什么会省钱?
a、省时间(一台做两台的工作)
b、省电 (200W VS 500-600W)
c、省试剂(可做5ul小体系)- 抗冷凝效果超强
20ulPCR体系,1元/孔,100元/块板
10ulPCR体系,0.5元/孔,50元/块板
5ulPCR体系 ,0.25元/孔,25元/块板 ;Piko?系列快速PCR仪 选型及耗材;Piko?系列快速PCR仪 选型及耗材;市场定位及竞争比较;竞争比较;Piko 96;竞争比较;Arktik 系列多功能PCR仪;目录;仪器选型;市场定位及竞争比较;竞争比较,;目录;光源;在体系中原料充足的情况下,产物按固定倍数呈指数增长
指数增长期间,初始模板浓度不同的样品的扩增曲线彼此平行;荧光定量PCR —— 荧光染料和探针;;;融解曲线分析(Tm);;;;多重荧光定量; 科学研究
- 转基因 (高精确度,高产量扩增)
- DNA 测序 (模板制备)
- 基因表达研究 (mRNA逆转录成cDNA,扩增)
- 古代DNA研究
- 生物系统学,分类学
医学应用
基因型分析
- 遗传病鉴定
- 癌症易感性筛查 (致癌基因)
- 个性化用药鉴定 (e.g. MTHR)
- 胚胎移植前诊断
器官移植,骨髓移植配型
传染性疾病检测
- 肺结核
- HIV; 模板定量
- 绝对定量
- 相对定量
;
基因表达研究 - qPCR最广的应用
- RNA 水平反映基因的转录活性
- RNA 逆转录为cDNA
- cDNA 荧光定量PCR
绝对定量
相对定量
;肿瘤基因 ERBB2在正常组织与肿瘤组织中的表达差异
目的:肿瘤基因 ERBB2是跨膜的酪胺酸激酶,在25%的乳腺癌病例中
有高表达。以看家基因GAPDH为内参,使用多重PCR TaqMan探针
技术,定量检测肿瘤组织与正常组织中ERBB2的表达量差异。
方法:肿瘤组织-提取mRNA-逆转录-同时扩增、检测ERBB2和GAPDH
正常组织-提取mRNA-逆转录-同时扩增、检测ERBB2和GAPDH
使用ERBB2和GAPDH的标准质粒作为绝对定量依据
;应用举例;应用举例;Healthy
RNA;;传染病检测:
大多采用病毒的绝对定量方法,如乙肝,丙肝,流感病毒的绝对定量
应用灵活方便,即可检测到种属,也可以检测到特定的病毒
无需病原微生物培养,无抗原抗体反应,实验方案可以根据病原微生物变异情况随时调整,灵活快捷。
;
肝炎类:甲肝,乙肝,丙肝,戊肝,庚肝
性病类:沙眼衣原体,解脲脲原体,淋球菌,人乳头瘤病毒,艾滋病病毒,梅毒螺旋体,单纯疱疹病毒等
优生优育类:弓形虫,风疹病毒,人巨细胞病毒,单纯疱疹病毒,科萨奇病毒等
呼吸道类:肺炎支原体,肺炎衣原体,新型冠状病毒,
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