耻垢分枝杆菌宿主整合因子（IHF）对DNA拓扑结构影响.PDFVIP

生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 2017, 44(12): 1110~ 1117 耻垢分枝杆菌宿主整合因子(IHF)对 DNA 拓扑结构的影响* 媛媛1, 2) 张先恩1, 3)** 毕利军4)** 1) 2) ( 中国科学院生物物理研究所，生物大分子国家重点实验室，北京100101； 国科学院大学，北京100049； 3) 4) 中国科学院生物大分子科教融合卓越中心，北京100101； 中国科学院生物物理研究所核酸生物学重点实验室，北京100101) 摘要 结核分枝杆菌(Mycobaterium tuberculos is)是结核病的病原菌，每年导致数百万人死亡 对于分枝杆菌基本生物学特性 的研究有助于新的药物及治疗手段的研发 耻垢分枝杆菌(M smegmatis)是分枝杆菌属 的一种非致病菌，与结核分枝杆菌亲 缘关系较近，是实验室常用的研究分枝杆菌的模式菌种 分枝杆菌主要编码三种染色质蛋白，类组蛋白HU 、Lsr2 和宿主整 合因子IHF 为研究IHF 在染色体包装中的作用，我们在大肠杆菌 表达、纯化了耻垢分枝杆菌IHF 蛋白(MsIHF) ，并对其 影响DNA 拓扑结构的性质进行了系统分析 体外研究的结果表明，MsIHF 以同二聚体的形式存在，其对负超螺旋DNA 具 有一定的结合偏好性，同时，该蛋白可以有效地固定DNA 负超螺旋 进一步的研究表明，MsIHF 可以调控拓扑异构酶的活 性 MsIHF 的结合明显地抑制拓扑异构酶 的松弛活性，而与此相反，该蛋白可以轻微地促进旋转酶引入DNA 负超螺旋的 能力 以上结果提示，MsIHF 可能通过调控拓扑异构酶的活性影响染色体DNA 的结构，进而调控其包装 关键词 分枝杆菌，宿主整合因子，DNA 结合蛋白，DNA 超螺旋，DNA 拓扑异构酶 学科分类号 Q71，Q51 DOI: 10.16476/j.pibb .20 17.0271 染色质蛋白在所有细胞生物 均发挥着至关重 具有较高的同源性，其结合可以明显地造成DNA 要的作用，它们负责在压缩包装基因组DNA 的同 弯折，然而该蛋白通常结合在特异的DNA 序列， 时调控DNA 复制、修复及转录过程中分子机器与 例如细菌基因组(attB 位点)及噬菌体DNA 上的整 基因组DNA 的互作 在细菌细胞 存在着多种 合位点(attP 位点)[8] DNA 结合蛋白( 例如，HU、IHF、H-NS 、Fis 及 不同的细菌门 染色质蛋白的种类及功能具有 Lrp 等) ，这些蛋白质共同将染色体DNA 包装成为 明显的多样性 其 放线菌(包括链霉菌及分枝杆 一个有序的结构———拟核[1-2] 这些蛋白质具有不 菌等) 编码HU 的类似蛋白但缺少明显的IHF 或 同程度的序列特异性，通过弯折、桥联或者缠绕 H-NS 的同源蛋白 近期的研究表明，分枝杆菌含 [3] [9] DNA 行使包装功能 此外，一些染色质蛋白还起 有一类H-NS 的同功蛋白———Lsr2 而在结核分 到了全局性的转录调控功能，缺失这类蛋白往往导 枝杆菌(Mycobaterium tuberc ulos is) 与耻垢分枝杆菌 致多效性的表型变化