RT-PCR-步骤(精).docVIP

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一、组织抽提: 1.?????? 取组织块50-100㎎用液氮在研钵中研磨成粉末 2.?????? 移入玻璃匀浆器加入1ml Trizol 抽打匀浆 3.?????? 移入1.5ml新离心管用5 ml针头抽打 4.?????? 冰上5分钟 5.?????? 离心12,000g 4℃ 5分钟 取上清液移入1.5ml新离心管 6.?????? 加0.2 ml氯仿,震荡,冰上5分钟 7.?????? 离心12,000g 4℃ 10分钟 取上层液相移入1.5ml新离心管 8.?????? 加0.5 ml异丙醇,震荡,冰上孵育5分钟 9.?????? 离心12,000g 4℃ 5分钟 弃去上清液 10.?? 加入1 ml 75%乙醇,震荡 11.?? 离心7,500g 4℃ 5分钟 弃去上清液 12.?? 室温下使之变透明 13.?? 加入DEPC处理水10μl --35μl 溶解RNA( 可保存在液氮或低温冰箱) 14.?? 走RNA变性电泳观察18s,28s条带,分光光度计检测260/280吸光度比值,计算RNA浓度 二、RT反应体系(第一步):约20分钟 RNA 抽提物 5μl Radome 引物 2μl RNA sin 0.5μl 1.?????? 65℃ 15分钟2.?????? 立即放入冰浴 RT反应体系(第二步):约2小时 RNA sin 0.5μl 10mM dNTP 1μl 5×RT 缓冲液 4μl 25mM MgCl2 4μl AMV 逆转录酶 3μl 1.?????? 37℃ 1.5小时2.?????? 94℃ 5-10分钟3.?????? 反应物保存于-20℃或进行PCR 三1、PCR反应体系:约4.5小时 25mM MgCl2 2μl 10×PCR 缓冲液 5μl 10mM dNTP 1μl 上下游引物10pmol/μl 2.5μl×2 CDNA模板 2.5μl ddH2O 34μl Taq酶 0.5μl 轻质石蜡油 50μl 100μl 1.?????? 94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟 为第一个步1个循环 2.?????? 94℃ 45秒,55℃ 40秒,72℃ 1分钟 为第二步30个循环 3.?????? 72℃ 10分钟4.?????? 取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳 三2、PCR反应体系:约5小时 25mM MgCl2 3μl 10×PCR 缓冲液 5μl 10mM dNTP 1μl 上下游引物10pmol/μl 2.5μl×2 CDNA模板 5μl ddH2O 30μl Taq酶 1μl 轻质石蜡油 50μl 100μl 1.?????? 94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟 为第一个步1个循环 2.?????? 94℃ 45秒,50℃ 40秒,72℃ 1分钟 为第二步40个循环 3.?????? 72℃ 10分钟4.?????? 取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳 四、电泳:约1.25小时 1.?????? 配0.5×TBE电泳缓冲液300 ml2.?????? 胶浓度1.7%(40ml 0.5×TBE加0.68g胶) 3.?????? 微波炉中火2分钟溶解胶4.?????? 冷却至60℃加入溴乙锭2μl(10mg/ml的终浓度0.5μg/ml) 5.?????? 放入梳子,浇板,待凝固6.?????? 加8μl PCR反应产物+2μl溴酚兰7.?电泳50-80V(每㎝ 5V) 一、实验器具与材料: 1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl 2、吸头:1ml、200μl、20μl 3、匀浆管:5ml 4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个 5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl 6、试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,带盖) 1个125ml的白色试剂瓶(放无水乙醇) 7、量筒:50ml、250ml、500ml 8、容量瓶:250ml、500ml、1000ml 9、试管架:5ml、1.5ml、20μl 10、盐水瓶:250ml、500ml各2个备用,一个装无水乙醇,另一个装DEPC水 11、铝制饭盒:4个 12、塑料小饭盒:1个 13、大瓷缸:2个 14、锡泊纸:一卷 15、卷纸:2卷 16、三角烧瓶:带盖,稍大 二、实验器具的处理与准备 1、塑料制品:(包括枪头、EP管、匀浆管等) 先将DEPC水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中,其中小枪头需要吸管打入DEPC水,过夜,然后高压,再烤干备用,实验前将枪头等放入吸头台,再高压一次(EP管) 2、玻璃制品:泡酸过夜,冲洗干净,蒙锡纸烤干备用(DEPC水泡)(洗净后先泡1‰DEPC

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