美味牛肝菌全基因组SSR位点的分布规律研究.PDFVIP

      菌物学报    jwxt@  15 March 2015, 34(2): 204‐214  Http://  Mycosystema ISSN1672‐6472   CN11‐5180/Q © 2015 IMCAS, all rights reserved.  研究论文 Research paper    DOI: 10.13346/j.mycosystema.140020  美味牛肝菌全基因组 SSR 位点的分布规律研究 王莹 陈明杰 汪虹 鲍大鹏* 国家食用菌工程技术研究中心  农业部南方食用菌资源利用重点实验室  上海市农业遗传育种重点开放实验室  上海市农 业科学院食用菌研究所  上海  201403  摘   要：研究利用生物信息学方法对美味牛肝菌全基因组中的 SSR 位点进行了统计分析，并与其他 3 种担子菌基因组（灰 盖鬼伞、裂褶菌、糙皮侧耳）进行了比较。结果表明，在美味牛肝菌基因组中存在 2 732 个 SSR 位点，SSR 间的平均距离为 17.1kb。73.02%的 SSR 位点分布在基因组中的非编码区，并以单核苷酸和三核苷