核酸与蛋白质的分析（II）12.pptVIP

核酸與蛋白質的分析 (II);上次課程複習;反轉譯出的核酸序列可能與原序列不同;反轉譯出的核酸序列與原序列不同， 是否可在Genbank中找到原序列?;提 示;Submit sequence for blast analysis;Format blast result;Wait for results;Blastn results;Search for short, nearly exact matches;反轉譯出的核酸序列，在Genbank中不找到原序列。 該怎麼辦?;上述序列是來自於 Xenopus laevis的TFIIIA 基因，如何才能查到此序列?;有了整個基因的核酸序列，要怎麼找相似的基因?;提 示;解答 – 尋找序列;解 答 - blastp;;;;若想知道TFIIIA 蛋???質中是否有蛋白質模組樣式(pattern)，應使用哪一個程式分析? ;解 答;甚麼是 ZINC_FINGER_C2H2_1?;鋅指(zinc finger)模組的發現 ;Diagonal MatrixMethod;Scoring;在Emboss套組中是否有繪製dotplot 的程式? ;解 答;甚麼是window size與threshold?;Window;Threshold;三維示意圖 ;在dotplot 上