应用基因芯片技术检测耐利福平结核分枝杆菌基因型资料精.pdfVIP

17 13 第 卷第 期 中国现代医学杂志 Vol.17No.13 2007 7 年 月 ChinaJournalofModernMedicine Jul.2007 1005-8982200713-1572-06 文章编号: ( ) ·论著· 应用基因芯片技术检测耐利福平 结核分枝杆菌基因型* 1 1 2 2 1 张俊仙 ,吴雪琼 ,邢婉丽 ,张 琼 ,梁建琴 , 2 1 3 1 1 张洪恩 ,陆 阳 ,张广宇 ,李洪敏 ,阳幼荣 1. 309 1000912. ( 解放军总医院第 临床部结研室,北京 ;生物芯片北京国家 工程研究中心 1000843. 050041 ,北京 ;河北省胸科医院,河北 石家庄 ) 摘要:目的 研制一种新型DNA芯片,用于快速检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因突变。方法 根据 结核分枝杆菌rpoB基因序列设计探针并制作DNA芯片,用TAMRA标记的引物扩增结核分枝杆菌rpoB基 DNA PCR-SSCP DNA 240 因突变热点的片断,与 芯片杂交,同时以 和 测序法为对照。结果 株结核分枝杆 菌临床分离株中 55 66 PCR-SSCP DNA , 株全敏感株和 株耐其他药物的利福平敏感株的 和 芯片杂交结果与 119 RFP DNA 117 rpoB 结核分枝杆菌标准株完全相同; 株耐 临床分离株中 芯片杂交有 株检测到 基因突变, 111 78 531 TCG→TTG Ser→Leu TCG→TGG Ser→Trp TCG→ 其中 株单位点突变, 株为 位密码子 ( )、 ( )和 TAC Ser→Tyr 24 526 CAC→TAC His→Tyr CAC→GAC His→Asp CAC→CCC ( )突变; 株为 位密码子 ( )、 ( )、 His→Pro CAC→CTC His→Leu CAC→CGC His→Arg 4 516 GAC→GTC ( )、 ( ) 和 ( ) 突变;株为 位密码子 Asp→Val GAC→GGC Asp→Gly 3 533 CTG→CCG Leu→Pro 1 511 ( )和 ( )突变; 株为 位密码子 (