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- 2019-06-15 发布于浙江
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WGCNA新手入门笔记2(含代码和数据)
上次我们介绍了WGCNA的入门(WGCNA新手入门笔记(含代码和数据)),大家在安装WGCNA包的时候,可能会遇到GO.db这个包安装不了的问题。主要问题应该是出在电脑的防火墙,安装时请关闭防火墙。
如果还有问题,请先单独安装AnnotationDbi这个包,
biocLite(AnnotationDbi)
再安装GO.db,并尝试从本地文件安装该包。
如果还有问题,请使用管理员身份运行R语言,尝试上述步骤。
另外如果大家问题解决了请在留言处留个言,告知大家是在哪一步解决了问题,谢谢!因为本人没有进行单因素实验,不知道到底是哪个因素改变了实验结果。。。
今天给大家过一遍代码。网盘中有代码和数据。
链接:/s/1bpvu9Dt
密码:w7g4
##导入数据##
library(WGCNA)options(stringsAsFactors = FALSE)enableWGCNAThreads()
enableWGCNAThreads()是指允许R语言程序最大线程运行,像我这电脑是4核CPU的,那么就能用上3核:
当然如果当前电脑没别的事,也可以满负荷运作
samples=read.csv( Sam_info.txt,sep = t,s = 1)expro=read.csv( ExpData.txt,sep = t,s = 1)dim(
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