大熊猫健康和寄生虫检测不同年龄段大熊猫肠道微生物菌群.doc免费

大熊猫健康和寄生虫检测（不同年龄段大熊猫肠道微生物菌群高通量测序研究）技术参数 1 取样 中标供应商负责到指定地点收取所有生物样品。 2 样本提取 使用CTAB+SDS对样本进行高效DNA提取，获得高质量基因组DNA，利用扩增子技术对样本进行特定区域扩增； 3 样本量 170 4 扩增区域 扩增区域为细菌（16SV4）和真菌ITS1 5 文库构建 采用原装进口建库试剂盒进行扩增子文库构建，构建PCR-free文库 6 测序平台 使用Illumina HiSeq2500测序平台进行测序；测序过程中原装进口测序试剂盒，测序读长为PE250 7 数据质量 原始下机数据测序质量要求：Q20≥85%，Q30≥80% 8 数据量 每个样本最低5万条Tags 9 数据质控 reads拼接、tags过滤、去嵌合体 10 标准分析内容 1)OTU聚类分析 2)物种注释和丰度分析 3) 样品复杂度分析 4) 多样品比较分析 5)环境因子关联分析 6)Network分析 7)PCoA分析 11 结果报告 内容： 1）结题报告 2）结果文件 3）微生物云平台服务 12 数据保存和递送 招标方提供硬盘，中标供应商负责拷贝数据并送至指定点 13 完成周期 提取＋检测（提取一次性成功的前提下）：32个自然日 样本检测合格至项目结题：50个自然日