异源四倍体鲫鲤中基因组以与转录水平的重组现象的发现.pdfVIP

根据这些SNP位点可以鉴定重组。 4．重组类型的分类和DNA序列的基本特征 本论文中的四个基因不管在基因组还是转录水平上都有重组现 象，将测得的原始杂交序列分类，然后在能分为母本序列和父本序列 的情况下，仍然能发现重组序列的存在，就说明重组确实是存在的。 异源四倍体鲫鲤中这四个基因的重组序列属于“遗传变异型，这些序 列从分子水平上证明了异源四倍体鲫鲤群体在进化过程中与其亲本 相比产生了很大的遗传变异。重组序列从两个方面进行分类，一是根 据SNP位点；二是根据与亲本同源序列的组成模式，其中“H．L类 型和“L．H，’类型最为常见。 这四个基因在鲤鱼、红鲫和异源四倍体鲫鲤中外显子长度没有差 异，只有个别核苷酸位点表现出差异，表现出较高的保守性，而这些 基因中能检测出内含子的DNA序列均有片段的缺失、插入，且这些 都存在于内含子部分，即内含子表现出与外显子不同的保守性。 5．系统发育分析 利用MEGA5．1软件，对鲤鱼、红鲫、异源四倍体鲫鲤以及其他 物种绘制ML系统发育进化树。在四个基因的进化树中，异源四倍体 鲫鲤始终与亲本鲤鱼、红鲫处于同一分枝上，与其他物种相比，鲤鱼、 红鲫和异源四倍体鲫鲤之间分化程度不高。且这三种鱼始终都与斑马 鱼聚集在同一枝上。另外，亲缘关系较近的鱼类始终聚集在同一大的 分枝上，同属于哺乳动物的荷兰猪、家鼠等也始终聚集在同一大的分 枝上，这在一定程度上证明了本文构建的系统发育树的准确性。 III 万方数据 总之，四倍体鲫鲤群体在基因组和转录水平上都有重组现象的发 生，且重组在进化中可能具有很重要的作用。 关键词：四倍体鲫鲤，转录水平，重组 IV 万方数据 ABSTRACT The theworld’Sfirstsuccessful allotetraploidhybrids(4nAT)is bisexualfertile animal areartificial tetraploidgroups．They hybridization withredcmcian auratusredvar．，2n=1 carp(Carassius 00，RCC，早)and L，2n=1 have Xiangiiangcarp(Cyprinuscarpio 00，CC，艿)，which from to bisexual and stablecharacteristics fertilitygenetic generation alsohavethe of acMomosome generation，and prerequisiteforming ofthe numberof200new thecharacteristics species．Study allotetraploid an inthe and levelofthe role genometranscri