人诱导多能干细胞重编程过程中长链非编码RNA的差异表达研究.PDF

天津医药2016年7月第44卷第7期 843 人诱导多能干细胞重编程过程中长链非编码RNA的 差异表达研究 俞茜，刘雅丽，范勇△ 摘要：目的 探讨人诱导多能干细胞重编程过程中长链非编码RNA（lncRNA）的表达改变及其作用。方法 利 用AgilentHumanlncRNA（4×180K）芯片检测人体细胞、诱导多能干细胞以及胚胎干细胞中lncRNA 的表达情况。通 过数据分析比较人体细胞诱导为多能干细胞后lncRNA 的差异表达，筛选出在重编程过程中可能发挥作用的 lncRNA。结果 人诱导多能干细胞lncRNA表达谱类似于胚胎干细胞而与体细胞不同。通过聚类分析发现诱导多 能干细胞与体细胞之间有3156个差异表达lncRNA。通过生物学分析发现人体细胞诱导为多能干细胞重编程过程 中有222个差异表达的lncRNA。结论 lncRNA在人诱导多能干细胞重编程过程中可能发挥着重要的作用。 关键词：多能干细胞；核重编程；芯片分析技术；长链非编码RNA 中图分类号：Q28 文献标志码：A DOI：10.11958 Studiesonthelongnon-codingRNAduringthereprogrammingofhumanpluripotentstemcells YUQian,LIUYali,FANYong△ KeyLaboratoryforMajorObstetricDiseasesofGuangdongProvince,TheThirdAffiliated HospitalofGuangzhouMedicalUniversity,Guangzhou510150,China △CorrespondingAuthor E-mail:yongfan011@gzhmu.edu.cn Abstract: Objective Toinvestigatethechangesandrolesofthelongnon-codingRNA （IncRNA）duringthe reprogrammingofhumaninducedpluripotentstemcells. Methods AgilentHumanlncRNA(4×180K)chipwasusedto checktheexpressionoflncRNAinsomaticcells,inducedpluripotentstemcellsandembryonicstemcells. Comparedwith differentiallyexpressedlncRNAinsomaticcellsandinducedpluripotentstemcells,lncRNAwasselectedthatmayplayan importantroleduringthereprogrammingofhumanpluripotentstemcells. Results ThelncRNAexpressionprofilesin inducedpluripotentstemcellsweresimilartoembryonicstemcells,butweredifferentfromthesomaticcells.Atotalof 3 156 differentiallyexpressedlncRNAswerefoundbetweenstemcellsandsomaticcellsbyclusteranalysis,and 222 differentiallyexpressedlncRNAswerefoundduringthereprogrammingprocessofhumanpluripotentstemcellsbybiological analysis.Conclusion