鹅羽色相关候选基因as临ip和tyrp1基因克隆、表达及snp检测.docxVIP

Molecular Molecular Clonging，Expression an d SNP Detection on ASIP and TYRPl in the Candidate Genes of Goose Plumage Color Discipline Animal Genetics and Breeding Direction Mo．1ecular breeding Advisor Prof．Anfang Liu Bof．Daqian He Candidate Jing Zhang A thesis submitted in fulfdlment of the requirements for the degree of Master Southwest University Chongqing，China June 2015 万方数据 孵嬲独创性声明 孵嬲 独创性声明 学位论文题目： 垫麴鱼担差堡造基国△曼!里独!Y婴!基国直隆! 表达及SNP检测 本人提交的学位论文是在导师指导下进行的研究工作及取得的研 究成果。论文中引用他人已经发表或出版过的研究成果，文中己加了 特别标注。对本研究及学位论文撰写曾做出贡献的老师、朋友、同仁 在文中作了明确说明并表示衷心感谢。 学位论文作者： 签字日期：0』肼 ／月王 日 学位论文版权使用授权书 本学位论文作者完全了解西南大学有关保留、使用学位论文的规 定，有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允 许论文被查阅和借阅。本人授权西南大学研究生院(筹)可以将学位 论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩 印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。 (保密的学位论文在解密后适用本授权书，本论文：口不保密， 口保密期限至 年 月止) 学位论文作者签名：：}长萝 导师签名：习与卜易 签字日期：ob，r年6月f日 签字日期：∥留年／月夕日 万方数据 本研究由国家现代农业产业技术体系 本研究由国家现代农业产业技术体系 项目 (CARS一43—3) 资助 万方数据 目录摘要 目录 摘要 I Abstract III 中英文缩略语表 ．．v 第1章文献综述 l 前言 1 1．1动物黑色素的研究现状 ．2 1．2黑色素合成相关基因 一4 l_3 ASIP基因的研究进展 ．6 1．4 TYRPl基因的研究进展 ．8 1．5单核苷酸多态性(sNP)的研究进展 ．10 第2章绪论 ．．13 2．1本实验的目的与意义 13 2．2本实验的主要研究内容 13 第3章材料与方法 ．15 3．1实验材料 15 3．2组织总RNA的提取(Trizol法) 18 3．3候选基因的组织表达分析 20 3．4血样DNA的提取(苯酚抽提法) 一21 3．5候选基因ASIP和TYRPI的SNP位点检测 一23 3．6候选基因ASIP和TYRPl的酶切分型 23 3．7候选基因ASIP和TYR_PI的系统进化树构建 24 3．8统计分析 24 第4章结果与分析 ．25 4．1鹅ASIP基因的克隆、表达谱和多态性分析 。25 4．2鹅TYRPl基因的克隆、表达谱及多态性分析 ．33 第5章讨论 ．45 5．1鹅ASIP基因的克隆、表达谱和多态性 ．．45 万方数据 5．2鹅TYRPl基因的克隆、表达谱和多态性 5．2鹅TYRPl基因的克隆、表达谱和多态性 ．． 47 第6章结论 ．． ． 5 1 参考文献 ． 5 3 致谢 6— l 攻读学位期间发表的学术论文目录 一 6 3 附录 6 5 万方数据 摘要摘 摘要 摘 要 羽色性状是禽类重要的经济性状，在育种上也是品种(系)选育的遗传标记， 在确定品种纯度和亲缘关系方面有一定用途。研究表明刺鼠信号蛋白基因(agouti signalingproteingene，ASIP)和酪氨酸酶相关蛋白一1(Tyrosinase relatedprotein一1， TYRPl)的变异与畜禽的毛(羽)色性状相关，是毛(羽)色遗传的重要候选基 因。本研究以浙东白鹅、皖西白鹅白羽、皖西白鹅花羽、狮头鹅白羽和狮头鹅灰 羽群体为试验材料，选取ASIP和TYRPl基因为鹅羽色性状相关的候选基因，开 展了鹅ASIP和TYRPl基因的核酸序列克隆、基因结构组成、组织表达谱分析及 基因组序列单核苷酸多态性(sNP)检测等相关研究。获得的主要研究结果如下： 1．采用比较基因组技术克隆获得了鹅ASIP基因完整的eDNA和基因组DNA 序列。扩增获得的cDNA序列长461bp(登录号：KP404626)，包含38 bp的5’一 端非编码区序列，390 bp的编码区(ORF)序列和20