生物信息学进展ChIP-Seq数据分析.ppt

GREAT- Genomic Regions Enrichment of Annotations Tool /great/public/html/ * Functional validation of TFBS Over expression Knockdown siRNA Knockout ZNF, TALENs, CRISPR/Cas9 Luciferase assay Transgenic assay E.g., from mouse ? zebrafish * 小结 ChIP-Seq是分析转录因子结合位点和组蛋白富集构象的有效技术 MACS是一个常用的Peak Calling软件 在一个生物研究项目中，ChIP-Seq实验、数据分析的完成，可能只是其中的一部分 其他内容包括 Gene Ontology analysis Functional Validation * 参考文献 /wiki/ChIP-sequencing /documents/products/datasheets/datasheet_truseq_chip_sample_prep_kit.pdf Zhang, Y., Liu, T., Meyer, C.A., Eeckhoute, J., Johnson, D.S., Bernstein, B.E., Nusbaum, C., Myers, R.M.