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研究生课程论文（作业）封面 （ 2012至2013学年度 第 1 学期 ） 课 程 名 称： 生物信息学原理与应用 课 程 编 号： 9.574 学 生 姓 名： 陈 斌 学 号： 120910805 年 级： 2012 级 任 课 教 师: 柏锡 教授 提 交 日 期： 2012 年 12 月 28 日 成 绩： 教 师 签 字： 开课----结课： 第 2 周----第 16 周 评 阅 日 期： 年 月 日 东北农业大学研究生部制 生物信息学综述 摘 要: 生物信息学(Bioinformatics)是建立在数学,计算机科学和生命科学基础之上的一门交叉学科。主要是对生物信息学的起源及概念进行论述,以及区别基因组信息学，重点对生物信息学的研究内容进行综述，并对国内外研究的热点问题进行讨论，最后是对发展前景提出未来展望。由于人类基因组计划的胜利完成与生物信息学的 发展密切相关，使生物信息学的发展为生命科学的发展和研究带来了很多的帮助，并对其进行一般性的分析。 关键词:生物信息学; 起源;基因组;蛋白质组学 生物信息学是80年代未随着人类基因组计划（Human genome project)的启动而兴起的一门新的交叉学科。随着生物科学和计算机科学的迅猛发展，由此而诞生的生物信息学逐渐发展成为一门独立的学科。其名字来源更早，生物信息学的概念是在1956年美国田纳西州盖特林堡召开的 生物学中的信息理论研讨会 上产生的。并由林华安博士在1987年正式为这一领域定下”生物信息学”这一称谓。生物信息学主要是一门运用生物学、数学、统计学、物理学、化学、信息科学以及计算机科学等诸多学科的理论方法研究生物学系统和生物学过程中信息流的综合系统科学，通过其独特的桥梁作用和整合作用 ， 使人们能够从各生物学科众多分散的观测资料中， 获得对生物学系统和生物学过程运作机制的理解， 最终达到自由应用于实践的目的。生物信息学的实质就是利用计算机科学和网络技术来解决生物学问题。 生物信息并不仅限于基因组信息，生物信息学也并不等同于基因组信息学。我们普遍认为生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头，破译隐藏在DNA序列中的遗传语言，找到代表蛋白质和DNA基因的编码区，特别是阐明非编码区的实质，从而认识生物有机体代谢、发育、分化和进化的规律；同时在发现了新基因信息之后进行蛋白质空间结构的模拟和预测，然后依据特定蛋白质的功能进行必要的药物设计。因此，现代生物信息学主要包括3个重要内容，它们分别是基因组信息学、蛋白质的结构模拟以及药物设计。基因组信息学是指从基因组水平研究遗传的学科。随着各种生物基因组测序计划的展开与分子结构测定技术的突破以及因特网的普及，无数的生物学数据如雨后春笋般迅速涌现。到目前为止，已经测出了上百种生物体的完整基因组序列。如何分析这些从实验过程中获得的大量原始数据，并从中获得与生物结构、功能相关的有用信息是当前困扰理论生物学家的一个棘手问题。解决这些问题又可以带来新技术的进步，推动生命科学的发展。 一、生物信息学与基因组研究的关系 利用数学模式和计算机处理数据的功能来处理和分析大量增加的人类基因组信息的结果，使人类基因组计划和生物信息学紧紧地结合起来了，而且随着两者的紧密结合和互相渗透，人类基因组计划的前进步伐会大大加快，从而提前完成计划，为人类造福。 生物信息学以基因组信息学为核心，主要任务是收集、储存、分发基因组的数据和信息，管理和分析、处理基因组及相关的蛋白质、mRNA 的信息，根据基因组数据和信息的比较分析，发现新的基因，并对基因结构和功能进行研究。在此基础上， 归纳、整理与基因组遗传信息释放及其调控相关的转录谱和蛋白质谱的数据 ， 从而认识生物代谢、发育、分化、进化的规律。因此生物信息学的研究内容是伴随着基因组研究的不断成功而发展的。也就是说 ， 生物信息学从事对基因组研究相关生物信息的获取、加工、储存、分配、分析和解释。这个定义的含义是双重的: 一是对海量数据的收集、整理与服务， 即管理好这些数据 ; 二是从中发现新的规律 ，用好这些数据。 人类基因组信息为药物发展提供了新的候选分子和新的候选药靶基因，基因组信息学提供的大量信息为这类技术的发展提供了广阔的天地。产生了许多新技术，其中有利用DNA探针阵列进行基因组研究的方法，其原理是通过更有效有作图、表达检测和多态性筛选方法