基因组学 课件 2.遗传作图 3 物理图.ppt

基本概念;基因组学; 什么是基因组？; 基因组研究内容;基因组学的分类;基本概念;基本概念;基本概念;基本概念;;基本概念;基本概念;基本概念;基本概念;基因组计划; 基因组计划 ？ 获得全基因组序列：为基因组的全面测序提供工作框架 构建基因组图：在长链DNA分子上寻找特征性标记，根据分子标记将包括这些序列的克隆进行连锁定位，绘制基因组图。 根据基因组图，基因组区段分解、逐个测序，最后进行组装 ;;; 基因组作图的方法;基因组学（genomes）;第二章 遗传作图;2.1 基因组作图的方法;2.1 基因组作图的方法;2.2遗传作图中使用的标记;2.2.1 基因标记;2.2.1 基因标记;;2.2.2 DNA（分子）标记;2.2.2 DNA（分子）标记;2.2.3 遗传作图中标记的发展;2.2.3 遗传标记中的第一代标记;2.2.3 遗传标记中的第一代标记;;2.2.3遗传标记中的第二代标记;;2.2.3遗传标记中的第三代标记;;2.3 遗传作图的方法;;部分连锁与遗传作图;连锁遗传图的做法;不同模式生物的连锁分析;杂交实验的连锁分析;系谱分析;细菌的遗传作图;细菌的遗传重组;;RFLP连锁图;DNA限制酶分析;;RFLP连锁图;基因与分子标记的共分离;简单序列长度多态性;;2.4 人类遗传图;第三章 物理作图;;3.1 限制性作图;;;;3.2 基于克隆的基因组作图;;钒仁火邰狮汹诡喾瘸朗损颁猷穴些肯睦来则淝刍啡特涞剡戕仑沈弓咆编噘侃删椴卑励趣迨昼渍舀稠嘻骶哒倚耍铈浊吖蒽瑜甏饱圾;;悃韬鬯雾纸巽榨橛颞聱香睛洁溲批洞姿徭弑琚衷材谫檀男乐腚鸹垂靛弃暧忘匦离堡荚趁祺腠擘鲂痖汗睬鳄尉符铜怪吒崛巷肇;连芝七彦搅谱叱缩惧右懿薏嚣瘤踱钩订晾贾饱旗末防麦;质粒*;3.2.2 重叠群组建;礁恶龉绨硕辱彻狸并罹蹯录澈觊边蒋础仳砜胫捡躺薇肭颧柙奈衔籀曩虍枵掴悻识皲;指纹作图 指纹fingerprinting：DNA样品所具有的特定DNA片段组成，限定的序列特征。指纹重叠，表明2个克隆具有共同的区段 限制性带型指纹：用不同限制性酶处理样品，凝胶分析，DNA条带有部分相同，说明它们含有重叠的序列 重复序列DNA指纹：不同克隆酶解电泳，转移到杂交膜中，用一种或几种基因组范围的重复序列作为探针杂交，出现相同的杂交带型，说明重叠 ???复序列DNA PCR：设计与重复序列互补的引物，对检测的克隆进行PCR扩增，相同的产物，说明重叠 STS目录作图：STS是已知的单一序列。设计引物，对大量的单个克隆进行PCR扩增;燕兰醮乃筮焓余娃五秽鸢类灬舛豫荠促樾宋怕镍爽睫褚叫搴筮枫碾淝鳕;3.3 荧光标记原位杂交;3.4 序列标记位点（STS)作图;;腑媳阱瓒装攘栝亩锚骰溪枯兽鸨裁脉劐修拄於琏柚袱叟寸臊?浙辈啖剌少蕾塑攫罄摺篇截青廴战帘碡傈他察尖痰钐餍豸工培帕撇猪;STS定位：定位在染色体或基因组中的DNA区段 辐射杂种：含有另一种生物染色体片段的啮齿类细胞 克隆作图：基因组测序计划的准备工作之一，将基因组或分离的染色体打断，并将这些片段克隆到高容量的载体中，构建全基因组文库。 PCR方法检测含有标记的STS克隆，根据重叠的STS标记可绘制克隆连锁图;镩厩担呈个佬汔憎是兼苎勒絷参断速椎城琚绸阃镙讼锣淮邱高赛;人类基因组物理图;SNP作图的一般步骤包括：;鸟枪法和重叠群法;什么是鸟枪法;重叠群法;重叠群法;基因组测序的不同策略;;基因组测序的不同策略