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第六章 DNA重组的操作
基因工程
外源DNA
载体DNA
重组分子
连接
?
1.基因文库
2.PCR
3.基因差异表达
第一节 DNA的体外重组
限制酶
—分子剪刀
限制酶
—分子剪刀
连接酶
—分子胶水
重组DNA分子
粘性末端连接效率最高!
黏性末端
黏性末端
1、粘性末端的连接
第一节 DNA的体外重组
1. 粘性末端连接
创造互补粘性末端的方法有哪些?
同种酶
同尾酶
第一节 DNA的体外重组
(1)两端具有相同粘末端的DNA分子之间的连接
第一节 DNA的体外重组
碱性磷酸酶:去掉其5’末端的磷酸基,以防质粒DNA的自身环化 。
注意:
目的基因正反向插入;
载体与多个目的基因片段重组。
1
2
3
1
2
3
4
4
3
4
第一节 DNA的体外重组
(2)两端具有不同粘性末端的DNA分子之间的连接
两种不同的限制性内切酶
两端会产生非互补的突出端
定向重组体
第一节 DNA的体外重组
质粒载体的定向重组
碱性磷酸酶?
避免了目的基因正反向插入
2. 平头末端连接
第一节 DNA的体外重组
平末端 平末端
SmaI限制酶
第一节 DNA的体外重组
T4 DNA连接酶虽然能连接平末端,但效率很低,只有粘性末端的1%。
5’端与3’端并列靠近的时间太短,不容易被连接酶连接。
(1) 直接连接
第一节 DNA的体外重组
(2) 人工加尾形成 “粘性末端”
a)同聚加尾 法
DNA末端转移酶
DNA末端转移酶能在没有模板的情况下给DNA的3’-OH端加上脱氧核苷酸,
利用DNA末端转移酶分别给载体和插入片断加上互补的核苷酸。
第一节 DNA的体外重组
非酶切位点
a)同聚加尾法
缺点:不能把插入片段再切下来。
第一节 DNA的体外重组
还有哪些方法能够创造粘性末端?
第一节 DNA的体外重组
b)衔接物(linker)连接
Linker:用化学合成法合成的一段10-12bp的特定限制性内切酶识别位点序列的平端双链。
GGAATTCC
CCTTAAGG
EcoRI linker:
第一节 DNA的体外重组
衔接物(linker)连接
第一节 DNA的体外重组
衔接物(linker)连接
优点:
1)可以用内切酶把插入片段切下来。
2)能给载体连接上Polylinker
缺点:
如果插入片段内部也有该酶位点,不能切下完整的插入片段
第一节 DNA的体外重组
c) DNA接头 (adapter)连接法
adapter:一头平末端、另一头粘性末端(某种酶切位点序列)。
adapter的作用:用T4DNA连接酶连到DNA分子的两端,直接成为人工粘性末端。
5‘p-GATCCCGG-OH3’
GGCC-p5’
BamHI adapter
第一节 DNA的体外重组
缺点:接头与接头会彼此以粘性末端接在一起,影响与DNA片段的连接。
防止自我连接:
先用碱性磷酸酶(CIP)处理接头
以后再用T4多核苷酸激酶加上磷酸。
DNA接头 (adapter)连接法
平头末端连接
(1) 直接连接
(2) 人工加尾形成 “粘性末端”
a)同聚加尾法
b)衔接物连接
c) DNA接头连接法
小结
PCR?
第一节 重组DNA分子的构建
3.PCR产物的连接
(1)在引物的5’端设计酶切位点
GCAGAATTC
互补序列
3’端15~20bp与模板互补;
5’端6~10bp是某个内切酶的识别序列
(5’端多余的3~5bp属保护碱基)
引物
第一节 DNA的体外重组
引物1
GCAGAATTC
互补序列
模板
EcoRI位点
5’-
-3’
GCAGAATTC
互补序列
5’-
-3’
3’
模板
GCAGAATTC
互补序列 PCR产物
5’-
-3’
3’
复性
延伸
模板
模板
3’
第一节 DNA的体外重组
GCTAGCCGG
互补序列
模板
BamH I 位点
-5’
3-’
复性
延伸
模板
模板
3’
3’
GCTAGCCGG
互补序列
3’-
模板
GCTAGCCGG
PCR产物 互补序列
引物2
3’
3’
第一节 DNA的体外重组
BamH I
EcoRI
质粒载体的定向重组
PCR
第一节 DNA的体外重组
(2)与T载体直接连接
Taq DNA聚合酶的特性:在DNA双链的3’端再加上一个多余的核苷酸(优先加A),因此PCR产物两个3’端
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