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9 3 Vol． 9 No． 3
第 卷 第 期 生物信息学
2 0 1 1 9 China Journal of Bioinformatics Sep． ，20 11
年 月
doi :10. 3969 /j ． issn． 1672 － 5565 ． 20 11． 03． 0 14
随机抽样对蛋白质相互作用网络度分布的影响
1，2 1 1，2 *
， ，
熊 杰 邴志桐 杨 磊
(1． ， ，730000 2 ． ， 100000)
中国科学院近代物理研究所 甘肃兰州 中国科学院研究生院 北京
: (PPI) ， ，PPI
摘 要 蛋白质相互作用 网络 是目前系统研究蛋白质层面细胞活动的重要工具 网络的度分布是研究复杂网络性
。 ， PPI ， 。
质的重要物理量 随着蛋白质相互作用数据量不断的增加 其数据的可靠性是否会对 网络的度分布造成影响 并不确定
PPI ， 5% ， PPI ， PPI
本文对四种模式生物的 网络数据 按照 的增长比率 随机删除 网络的边 来检验随机抽样对 网络度分布的影
。 ， PPI ， ，
响 结果表明 各种实验数据的误差不会对真实 网络的度分布造成干扰 且在目前描述网络度分布的五种函数中 广延指
数函数拟合程度最优。
: ; ; ; ;
关键词 蛋白质相互作用网络 度分布 随机抽样 无标度网络 广延指数分布
中图分类号:Q61 文献标识码:A 文章编号:1672 － 5565 (2011)－ 03 － 235 － 04
Effects on degree distribution of protein － protein
interaction with random removal
XIONG Jie1，2 ，BING Zhi-tong1 ，YANG Lei1 ，2*
(1． Institute of Modern Physics ，Chinese Academy of Sciences ，Lanzhou Gansu 730000 ，China ;
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