新型氨基酸描述子与其在肽QSAR中的应用.pdfVIP

新型氨基酸描述子及其在肽QSAR中的应用 摘要 肽是重要的生命物质基础之一，其作用涉及生命过程的各个环节，因此， structure 肽的定量构效关系(quantitativeactivity 引起了众多科学家的高度重视，成为了热门的研究课题。因为肽的空间结构 与功能信息由其序列中的一级结构即氨基酸决定，所以解析氨基酸的结构特 征对肽的QSAR研究变得尤为重要。本文从天然氨基酸的结构特征出发， function and scoresvectorofradialdistribution descriptors component geometrical distribution 通过对其中150个RDF(radial 个几何指数分别进行主成分分析(principalcomponent ofelectronic scoresvector 特性。SVEEVA(principalcomponent eigenvalue eigenvalue 型氨基酸描述子均能较好的表征肽的结构信息，且具有使用简便与拓展性能 好等优点。 转化酶抑制剂、苦味活性二肽、后叶催产素类似物及抗菌十八肽的结构，然 linear 后采用逐步线性回归结合偏最d-乘回归(stepwise least square linear linear (stepwiseregression-multiple 所选描述子与其生物活性间建立了有效的QSAR模型。同时采用内部和外 部双重验证的方法对所建模型的稳定性以及预测能力进行了深入分析和评 价。结果显示，采用两种新型氨基酸描述子表征肽所建模型的稳定性与预测 能力较强。 第一章主要概述了QSAR以及肽的QSAR研究的意义、进展和特点， 同时，简单的介绍了本文的主要研究内容。 第二章主要介绍了肽的QSAR研究中的分子结构表征方法及建模技术。 模技术方面，具体的介绍了多元线性回归、主成分分析和偏最小二乘回归的 原理和方法。另外，对变量筛选和模型质量评价方法亦作了比较详细的描述。 第三章主要介绍了新型氨基酸描述子SVRG和SVEEVA应用于各种功 能肽或其类似物，包括58个血管紧张素转化酶抑制剂、48个苦味活性二肽、 21个后叶催产素类似物和12个抗菌十八肽序列的定量构效关系研究，选择 性地使用偏最小二乘回归或多元线性回归建立其QSAR模型，并分别进行 了分析和小结。 第四章主要对本研究作了一个概括性的总结，并对本研究的未来进行了 展望。 关键词：定量构效关系，氨基酸，肽，SVRG，SVEEVA lI NoVEL DESCRIPToRSoFAMINoACIDSANDTHEIR APPLICATIoNSINPEPTIDE QSAR ABSTRACT a rolein world inhumanlife Peptidesplaysignifcantbiologicalespecially and in avast of arein participatearraybiolog