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真核细胞的基因的3’UTR包括从终止密码子到末端之间的区域,长度约1000bp。大多数基因具有3’polyA结构。 mRNA需要加上polyA之后才能运送到细胞质中。 3’polyA结构对于维持mRNA的稳定性和翻译效率也具有重要作用。 有研究表明,3’端polyA的长度与该mRNA的寿命有关,翻译的次数越多,尾巴就越短;mRNA被降解之前也要先去掉尾巴。polyA结合蛋白(PABP)可以与尾巴结合,控制尾巴的长度,并防止被降解。 3’端的polyA尾巴对5’端的帽子具有保护作用。mRNA在核糖体上翻译时是呈环形结构的,其中尾巴结合蛋白与起始因子eIF-4E等的结合非常重要。如果尾巴没有或太短,尾巴结合蛋白就无法与尾巴结合,从而无法形成环状结构;polyA长度缩短会导致5’端帽子结构也开始消失。 polyA尾巴还可以调节翻译的效率,有发现有卵细胞中的基因polyA尾巴过短没有活性,一旦受精后,这些基因的尾巴就被加长,随即开始蛋白质的合成。 研究发现3‘UTR的核苷酸序列及其结合蛋白也可以调节mRNA的稳定性。许多哺乳动物的mRNA3’UTR中含有一段富含AU的序列,称为AURE(AU-rich elements),这些基因的寿命较短。可能是由于某种蛋白与AURE结合,导致与外切酶和内切酶结合,加速了mRNA的降解。 实验发现,可以通过调节polyA的长度来调节mRNA的稳定性。如组蛋白没有尾巴,如果人工加尾,会延长半衰期10倍。另外雌激素还可以调节卵黄蛋白mRNA的寿命几十倍。 调节mRNA的稳定性是调节蛋白质翻译的一种手段。 在某些类型的细胞中加入调节物质可以使某种特殊蛋白质的合成增加,这可能与提高mRNA的稳定性有关,也可能与基因的转录速度提高有关,原因是多方面的。 一些蛋白直接与mRNA结合,起翻译阻遏物的作用,一般结合在mRNA的3‘端UTR区,阻止翻译的起始。 许多基因受到翻译抑制的调控 当细胞生长变慢时,酵母和人细胞中有一种蛋白通过干扰eIF4E和eIF4G之间的作用,从而抑制蛋白的翻译;细胞生长恢复时,该蛋白失活,蛋白质合成得以恢复。 有时细胞对某种蛋白的需求量在短时间内迅速增加,这时依靠基因转录加工再翻译就可能来不及,这类基因的表达调控就会发生在翻译水平上。此时只需将被阻遏的mRNA解除抑制,就可以迅速合成所需的蛋白质了。 这种抑制性的调控对于很长的基因(有个别基因长度达几百万碱基,如果转录再合成则需要至少1个小时!)来说尤为重要。 有些基因受到转录和翻译双重调节,则翻译水平上的是属于“细调”。 在某些细胞如红细胞中,则只能进行翻译水平的调节。 3.5 翻译后水平的调控 真核细胞的蛋白质在合成后还要经过复杂的加工修饰过程,才能成为成熟的蛋白质分子;然后再经过正确的运输,到达目的地后才算完成蛋白质的翻译过程。这个过程也是非常复杂的。 蛋白质合成后的加工修饰方式多种多样,这里不再重复。 RNA对基因表达的调节作用 第四节 以上我们介绍的基因表达调控是属于DNA与蛋白质之间的相互作用,进来研究发现,细胞内的RNA分子也同样可以对基因的表达进行调控,而且这是一种非常古老、历史悠久的而且有效的调控手段! 非编码RNA (Non-coding RNA, ncRNA) 它是指除mRNA、tRNA、rRNA以外, 不编码蛋白质的有功能的RNA分子。它们在细菌、真菌、哺乳动物等许多生物体的重要生命活动中发挥着极广泛的调控作用。 ncRNA在染色体的转录与失活、基因的表达与关闭、细胞周期乃至个体发育等过程中均具有重要的作用。对其进行研究,可能对揭示基因转录后调控、基因敲除、人类疾病防治及生物进化探索有重要意义。 来自基因组的所有转录产物大致可以分为两大类:编码蛋白质的mRNA和非编码RNA。许多年来基因组中大部分非编码部分被认为是基因垃圾(genetic junk),且通常被认为是没有功能的。 然而研究发现,这些非编码序列具有与编码蛋白质的基因同样重要的功能,它们包含其他的信息或功能。虽然人类基因组序列还没有彻底完成,但现已清楚表明编码蛋白质的序列只占到基因组全长的2%。 在其他的真核生物基因组中,我们发现生物体越复杂,不编码蛋白质的部分在基因组中所占比例越大。在酵母中大约有30%的基因组DNA不编码蛋白质,而果蝇基因组中的非编码DNA比例占到了75%。 另一方面,一些真核生物基因组的全部序列的确定结果也很令人失望。编码蛋白质的基因数量远远低于人们当初的预想。线虫和昆虫的基因组DNA的数量只是酵母或细菌基因组的两倍,哺乳动物的基因组数量是非脊椎动物的两倍。 在哺乳动物中基因组的数目是非常保守的。人类99%编码蛋白质的基因与鼠的基因是同源的。在不同个体中编码蛋白质的基因占整个基因组比例的可变性大约在0.3%。 人的基因组中只有1
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