李磊Toronto学习及工作经历_李磊.PDFVIP

姓 名 李磊 性 别 男 出生年月 1973 、12 出生地 西安 婚姻状况 已婚 政治面貌 国 籍 中国 从事专业 生物信息学 现工作单位及职位 University of Toronto, Canada, 博士后 人事关系所在单位 Hospital for sick children, University of Toronto 学习及工作经历： （从大学开始填，内容包括时间、单位、学位、所学专业、从事专业、专业技术 职务情况，时间段要连续，准确到月份） 1992.9-1996.7南京航空航天大学，机电一体化， 本科 1996.8-1998.8 计算机程序助理工程师，中国实验飞行研究院，西安 1998.9-2001.3南京航空航天大学，计算机工程(计算机辅助设计)，硕士研究生 2001.4-2002.2 待业 2002.3-2006.5 Nanyang Technological University, Singapore, Bioinformatics, 博士研究生 导师：Jacob Gan Pandjassarame Kangueane 2006.1-2010.4 博士后，Biochemistry Department, The University of Western Ontario, Canada 导师：Shawn Li 2010.5-至今 博士后，Hospital for sick children, Department of Molecular Genetics, The University of Toronto, Canada 导师：Michael Moran 如内容较多，本栏目填不下时，可另纸接续（下同）。 1 主要学术成就、科技成果及创新点： 李磊博士长期从事生物生物信息学领域关于分子信号通道上的研究工作。在 蛋白质间相互作用的分析预测、蛋白质结构域的结合特性和磷酸化系统网络研究 等方面发表论文 15 篇。主要成果包含以下几点： 1. 酪氨酸磷酸化，因为与细胞生长分裂紧密相关, 从而和肿瘤生长有密切关系。多 种酪氨酸激酶是已知的癌症药物靶位。以往的对酪氨酸磷酸化研究是把酪氨酸激酶，它 的底物以及下游的信号蛋白这三部分进行独立研究，而忽略了它们之间的整体性和相互 关系。我通过构建两个人体酪氨酸磷酸化信号网络（一个是通过检索文献，一个是通过 预测算法）， 应用生物信息学和统计学知识，研究了此信号网络的进化以及它与癌症的 关系。李磊博士发现人类酪氨酸磷酸化网络可以细分成三类：细胞内网络、细胞间网 络和组织特异性网络; 此三类网络是在不同的进化区间进化出来的。此外，连接多个激 酶和下游的信号蛋白的磷酸化位点在癌症的酪氨酸磷酸化信号网络中起着关键的作用。 这个发现加深了对癌症的理解，对癌症治疗靶位的确定有促进作用。 2.含有 SH2 结构域的蛋白是酪氨酸激酶的下游信号蛋白中的最大一类。此类蛋 白含有 110 个蛋白和 120 个 SH2 结构域。他们通过 SH2 结构域结合酪氨酸激酶底物 SH2 结构域的结合特性对理解酪氨酸磷酸化信号网络起着 的磷酸化位点来传导信号。 至关重要的作用。Dr. Shawn Li 实验室大规模地对所有 120 个 SH2 结构域进行了研究， 得到了 76 个 SH2 结构域结合特性的实验数据。李磊博士对这些实验数据进行分 析，根据特性将它们进行分类，并建立预测模型和算法。此结构域的已知的三维 结构对数据分析结果给予了佐证。此外，通过生物实验证明，所建的预测算法优 于以往通用算法，并且覆盖了更多的 SH2 结构域。通过对 SH2 结构域结合特性的 大规模实验分析和预测建模，促进了对酪氨酸磷酸化信号网络的理解。 3.信号蛋白一般含有多个用于传递信号的结构域，如 SH2 结构域、SH3 结 构域和 PDZ 结构域。虽然已经开发出来了不少对于这些结构域结合特性的预测 算法，但是大规模高通量的蛋白相互作用实验数据（如：结构域微阵