背角无齿蚌不同组织的基因组DNA甲基化分析-生态环境学报.pdf

生态环境学报 2009, 18(6): 2011-2016 Ecology and Environmental Sciences E-mail: editor@ 背角无齿蚌不同组织的基因组 DNA 甲基化分析 曹哲明 1，2 ，杨健1，2* 1. 南京农业大学无锡渔业学院，江苏 无锡 214081 ； 2. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心// 中国水产科学研究院内陆渔业环境与资源重点开放实验室，江苏 无锡 214081 摘要：用甲基化敏感扩增多态性（MSAP ）对背角无齿蚌（Anodonta woodiana ）腮、唇瓣、闭壳肌、外套膜和斧足五个组织 基因组DNACCGG 区域的甲基化水平进行了分析。结果表明，背角无齿蚌腮基因组DNA 甲基化比例为47.9% ，唇瓣甲基化 比例为35.5% ，闭壳肌甲基化比例为50% ，外套膜甲基化比例为46.3% ，斧足甲基化比例为56% ；基因组中CCGG 区域存 在甲基化现象。不同组合甲基化比例不同说明该区域甲基化可能参与到基因的调控中。通过比较不同地点的采集的背角无齿 蚌，发现污染严重地区(太湖三山岛水域)采集到的样品和非污染地区（南泉养殖水域）采集的蚌样甲基化区域略有变化。其 中的相关性有待进一步的研究。 关键词：背角无齿蚌；甲基化；甲基化敏感扩增多态性 中图分类号：171.5 文献标识码：A 文章编号：1674-5906 （2009 ）06-2011-06 背角无齿蚌（Anodonta woodiana ）属软体动物 auratus ）基因组DNA 甲基化水平的影响；王丙莲[16] 门，瓣鳃纲，蚌科，为我国常见的种类，广泛分布 等用高效液相色谱分析了镉、铅等对泥鳅 于各省的江河、湖泊、水库、沟渠及池塘中。前苏 （Misgurnus anguillicaudatus ）基因组DNA 甲基化水 联、日本、朝鲜、泰国、柬埔寨、印度境内也有分 平的影响；Vandegehuchte[17]等分析了镉对大圣虱 布。肉可食，也可以作为鱼类、禽类、家畜的饲料； （Daphnia magna ）基因组DNA 甲基化的影响。结果 有的地区用为淡水育珠蚌。目前国内关于背角无齿 一致认为重金属离子可以对这些动物的基因组 蚌的研究报道主要集中在重金属或有机农药的积 DNA 甲基化产生影响。现已表明从细菌到植物和真 [1-5] [6-7] [8-9] 累和毒理学 、及其免疫学 、形态学 、饲养 菌、从无脊椎动物到脊椎动物等几乎所有生物体内 驯化[10-12]等方面。国外对该种的研究相对较少，更 都存在DNA启动子CpG岛甲基化，只是不同物种甲 多的是对相同属中其它种重金属和有机污染物的 基化方式和作用不尽相同而已。由于大部分甲基化 积累方面[13-14]。背角无齿蚌在重金属及其他污染物 研究报道集中在脊椎动物上，无脊椎动物这方面的 监测和毒理研究方面具有很大的优势，已被笔者的 研究比较少，所以甲基化在无脊椎动物基因调控中 研究室用做“淡水贝类观察”的生物指示贝种。然而， 的作用仍需进一步深入研究。 有关该种类种群遗传，基因表达调控等方面却鲜见 对基因组甲基化进行整体研究的技术最常用 研究。这些背景知识的不足可能会阻碍对该种类在 的是甲基敏感扩增多态性技术（Methylation Sensi- 污染物生物积累和毒理学方面机理的解释，也可能 tive Amplified Polymorphism ，MSAP ），该方法是 限制它在相关领域进一步的应用前景。 AFLP技术的延伸，利用具有相同识别位点（CCGG ） 前述的研究显示，背角无齿蚌及相关种类可以 的不同限制性内切酶（Hpa Ⅱ和Msp Ⅰ）对目标位 积累和残留较高浓度的重金属等污染物，而这种积 点甲基化与否的敏感性