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琼 脂 糖 凝 胶 电 泳 一 实验目的 学习琼脂糖凝胶电泳分离DNA的原理和方法 检测水稻总DNA的纯度与分子量 检测PCR的结果 二 实验原理 电泳是分离和纯化DNA片段的最常用技术 琼脂糖是一种天然聚合长链状分子,沸水中溶解,45℃ 开始形成多孔性刚性滤孔,凝胶孔径的大小决定于琼脂糖的浓度 DNA分子在碱性环境中带负电荷,在外加电场作用下向正极泳动 二 实验原理 DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时,有电荷效应与分子筛效应。不同的DNA,分子量大小及构型不同,电泳时的泳动率就不同,从而分出不同的区带 琼脂糖凝胶电泳法分离DNA,是利用分子筛效应,迁移速度与分子量的对数值成反比关系 可依据DNA分子的大小使其分离 DNA分子在电泳条件下的迁移演示.exe Goodview可与DNA分子形成复合物,发射的荧光强度较游离的Goodview强度大10倍以上,且荧光强度与DAN含量成正比 示踪染料和分子量标准参照物 二 实验原理 M 1 2 3 4 PCR产物的 琼脂糖凝胶电泳 三 实验材料、用具及试剂 提取的水稻总DNA和PCR产物 电泳仪,电泳槽,电子水平,移液器,枪头,三角瓶、点样板,微波炉等 琼脂糖,TAE电泳缓冲液, Goodview,载样缓冲液(Loading buffer) 四、实验步骤 1 制胶: 100ml(0.5×TAE)+0.8g琼脂糖 三角瓶(1/3) 煮胶 溶解,冷却至60℃(不烫手),加Goodview,倒板(4-6mm),室温下充分凝固,竖直拔下梳子 2 点样: 5μl水稻总DNA+1μ2 loading buffer=7μl PCR产物+3μl loading buffer,混匀,吸取10μl 10μl ⅢMark DNA(λ DNA-HindⅢ ) 3 电泳:电压3-5V/cm,约80-90V,注意电极方向 4 观察:紫外透射分析仪下观察,时间不要太久 四、实验步骤 五 注意事项 1 倒胶时把握好胶的温度,不要高于60℃ ,否则温度太高会使制板变形 2 胶一定要凝固好才能拔梳子,方向一定要竖直向上,不要弄坏点样孔 3 点样时枪头下伸,点样孔内不能有气泡,缓冲液不要太多 4 Goodview有毒,切勿用手接触,更不要污染环境,胶勿乱扔 5 紫外线照射不要太久 六 作业 画出电泳图,分析观察到的结果
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