生物化学A上-4蛋白质二级结构.pptx

蛋白质;上节复习氨基酸;L-氨基酸的基本结构;L型氨基酸 与 D型氨基酸;22种一级氨基酸的名称与符号*;21种氨基酸的分类*;非极性氨基酸;芳香族基团氨基酸;极性不带电氨基酸;极性带正电氨基酸;极性带负电氨基酸;出现在蛋白质上的氨基酸修饰;游离型氨基酸衍生物;氨基酸的理化性质;氨基酸的两性离子;等电点 (isoelectric point, pI);氨基酸等电点的计算;蛋白质一级结构的测定;Sanger试剂(FDNB)标记N末端;Edman 降解法(I);Edman 降解法(II)-优越性;肽键的专一性水解(化学法);泛用酶： 胰蛋白酶（trypsin）； Lys-X, Arg-X (X≠Pro) 胰糜乳蛋白酶（chymotrypsin）；Y-X（Y=Y,F,W; X≠Pro) 嗜热菌蛋白酶（thermolysin）； 木瓜蛋白酶（papain）； X-Y (X=R,K,Q,H,Y) 胃蛋白酶（pepsin）； X-Y（Y=Y,F,W; X≠Pro) 枯草杆菌碱性蛋白酶（subtilisin） 专一酶： Lys-X; X-Lys; Arg-X; Glu-X; X-Asp; Pro-X; Asn-X , 商品名：Endoproteinase Asn-C;现用蛋白质一级结构分析方法;分离纯化蛋白质;蛋白质;一级结构;蛋白质结构的层次;作用力 破坏因子 氢键：α-螺旋，β-折叠 尿素，盐酸胍 疏水作用：形成球蛋白的核心 去垢剂，有机溶剂 Van der Waals力：稳定紧密堆积的集团和原子 离子键：稳定α-螺旋，三、四级结构 酸、碱 二硫键：稳定三、四级结构 还原剂 配位键：与金属离子的结合 螯合剂 EDTA;;蛋白质的二级结构;蛋白质二级结构;肽键的特征;肽键（peptide bond）的形成;肽键将氨基酸与氨基酸头尾相连; 肽 键;肽键平面;两个肽平面以一个Cα为中心发生旋转;二面角(Dihedral Angle);肽链中的肽平面;Ramachandran Plot;蛋白质二级结构的主要形式;? -helix;α- 螺 旋 的 特 性;Linus Carl Pauling (1901-1994);肽平面的相叠形成α螺旋;氨基酸残基侧链可影响α-螺旋的形成;左旋和右旋的判断;Pauling预测的三种螺旋结构;Alpha helices on Ramachandran diagram;β-sheet; β-折叠的特点：; β-折叠有平行和反平行的两种形式: ;反平行β折叠;平行β折叠;β折叠的侧链位置;?-转角（β-turn）和无规卷曲;五种不同的转角;β转角相当于半圈3.010 螺旋;细胞色素C的三级结构;20种氨基酸在二级结构中出现的频率;;蛋白质的超二级结构和三、四级结构;蛋白质的结构层次;;超二级结构的类型;Ferritin(铁蛋白);The α helical coiled coil ;βαβ在蛋白质中(Rossmann折叠);GFP：?+?;β折叠在蛋白质中的不同形式;理论上四条β折叠有12种组合，但是…;Up and down βBarrel;Greek key 的由来;β barrel with Greek key ;β propeller ;β – sheet formed structure;结构域(domain);It is useful to think of proteins as containing discrete domains whose conformation is generally independent of other domains in the protein The domains are usually globular and consist of 100 to 400 amino acids that fold independently We think of these domains as “beads on a string” Often each domain is encoded by a distinct exon of a gene;免疫球蛋白中的结构域;蛋白质的三级结构;越来越多的蛋白结构被解析;蛋白质几种不同的立体结构表示法;X-Ray衍射测定蛋白质空间构象; 1895年，德国实验物理学家伦琴（Wilhelm Konrad Rontgen）发现了X-射线 ，并在向德国维尔兹堡物理和医学学会递交的研究通讯《一种新射线——初步报告》中