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实验一、植物基因组DNA的提取及电泳
什么是DNA重组技术、克隆、载体
DNA重组技术:基因工程,指不同的DNA片段按照预先的设计定向连接起来,在特定受体细胞中与载体同时复制并得到表达,产生影响受体细胞的新的遗传性状的技术。
克隆:应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质——同源或异源、原核或真核、天然或人工的DNA与载体DNA相结合成一具有自我复制能力的DNA分子——复制子,继而通过转化或转染宿主细胞、筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增、提取获得大量同一DNA分子,即DNA克隆
载体:将DNA片段(目的基因)转移至受体细胞的一种能自我复制的DNA分子
克隆的步骤(基因的获得、载体的连接。。。。)
电泳影响因素(电泳的方向速与什么相关)1.电泳介质的pH 2.缓冲液的离子强度 3.电场强度 4.电渗作用 5.对支持物的选择 6.温度对电泳的影响
电泳的试剂作用(染料是什么,上样缓冲液的作用)
溴化乙锭(染色剂),上样缓冲液(指示电泳程度,维持合适的PH),marker(作为标尺,判断样品的长度)
植物基因组DNA的提取用CTAB法
β-巯基乙醇可以抑制酚类化合物的氧化
EDTA抑制DNA酶的活性
苯酚、氯仿可变性蛋白质
异丙醇沉淀基因组DNA
用RNase去除RNA污染
电泳结果的分析:条带、点带孔里的、RNA污染的
实验二、PCR扩增目的基因
什么是PCR、引物
PCR: 通过模拟体内DNA复制方式在体外选择性地将DNA某个特定区域扩增出来的技术
引物:指的是一小段单链DNA或RNA,作为DNA复制的起始点
PCR主要步骤原理
首先将双链DNA分子在临近沸点温度下加热分离成两条单链DNA分子,DNA聚合酶以单链DNA为模板并利用反应混合物中的四种脱氧核苷三磷酸合成新生的DNA互补链
主要的试剂种类:10×反应缓冲液、dNTP、引物1、引物2、模板DNA、Taq DNA酶
结果的分析,会看marker与设计的大小的对应的关系
实验四、T载体连接
T载体:是一种高效克隆 PCR 产物(TA克隆)的专用质粒载体,为线性化载体,无需酶切可直接与具有A末端的PCR产物连接
多克隆位点:包含多个限制性酶切位点的一段很短的DNA序列
TA克隆连接原理(有个A所以能连接)
大部分耐热性DNA聚合酶进行PCR反应时都具有在PCR产 物的3’末端添加一个“A”的特性,人们在线性化平末端载体的两端分别又人工加上一个额外的T碱基,从而可与PCR克隆产物的A末端互补配对
P10的图:三个主要箭头是什么
Ampr:氨苄青霉素抗性基因 ori:复制起始位点 lacZ:乳糖操纵子
实验五、感受态细胞制备及转化
转化:指质粒DNA或以它为载体构建的重组子导入细菌的过程
感受态细胞:处于容易吸收外源DNA的状态的细胞
感受态细胞制备的原理
细菌处于0℃,CaCl2低渗溶液中,细胞膨胀成球形。转化混合物中的DNA形成DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面,经42℃短时间热击处理,促进细胞吸收DNA复合物。
蓝白斑与X-Gal、IPTG关系、LacZ与蓝白斑、蓝白斑筛选原理(与转化相连接起来)(为什么蓝,为什么白)
IPTG能诱导乳糖操作子转录生成β-半乳糖苷酶。β-半乳糖苷酶可以将无色化合物X-Gal切割成半乳糖和深蓝色的物质,使菌落呈蓝色。T载体的多克隆位点在lacZ上,经过转化插入外源基因后,lacZ被打断,无法形成完整的酶,故不能切割X-Gal为深蓝色物质。T载体中含有Ampr,使成功转化的细菌能在含Amp的培养基上存活,所以白斑菌落导入的是含有外源基因的质粒,蓝斑导入的是不含外源基因的质粒
实验六
菌落PCR的概念:不提取不鉴定,直接以一个菌体热解暴露的DNA为模板进行PCR扩增。
实验七、质粒DNA的提取、纯化
质粒:细胞染色体外能自主复制的很小的环状DNA分子
提取原理:
在PH高达12.6的碱性条件下,染色体DNA的请柬断裂,双螺旋结构解开而变性。质粒DNA的大部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环状的两条互补链不会完全分离,当以PH4.8的NaAc高盐缓冲液去调节PH至中性时,变性的质粒DNA又恢复原来的构型,保存在溶液中,而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA、蛋白质-SDS复合物一起沉淀下来而去除。
结果分析:三个条带位置关系,质粒三个构型与快慢
开环DNA:如果质粒DNA两条链中有一条链发生一处或多处断裂,分子就能旋转而消除链的张力,形成松弛型的环状分子,称为开环DNA
溶液1:Tris(调PH)、EDTA(抑制DNA酶活性,减少对DNA降解)
溶液2:NaOH(碱性调节)、SDS(蛋白质变性)
溶液3:Kac(乙酸钾,中和碱性,使基因组DNA沉淀、质粒
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