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鱼类线粒体基因组研究进展 生物的遗传 DNA的分布 主要在染色体上 细胞质内 细胞核遗传 细胞质遗传 （所以说，染色体是DNA的主要载体） 例：紫茉莉叶色的遗传 细胞核遗传与细胞质遗传 研究背景 线粒体是存在于绝大多数真核细胞内的一种基本的重要的细胞器，1850年被发现，1898年被命名，它含有自己的DNA，具有相对独立的遗传系统。它是细胞进行氧化磷酸化的场所。线粒体基因组不仅是研究DNA结构与复制转录的良好模型，也是研究真核细胞核酸与蛋白质合成非常合适的模型系统。 线粒体遗传的分子基础 线粒体DNA(mtDNA)的分子特点 裸露的双链闭合环状分子（也有线性的） 没有重复序列 浮力密度比较低 G、C含量较低 一条为重链（H链），一条为轻链(L链） 每个细胞含多个线粒体，每个线粒体含多个mtDNA 线粒体基因组 1981年，Anderson完成了人线粒体基因组全序列的测定。 双链16569bp，其中一条为重链，一条为轻链。基因编码物各不相同。 2种rRNA；22种tRNA；13种蛋白质。 基因中不含非编码序列，多数情况下，几乎不含终止密码，mRNA在特定区域加PolyA。 转录与翻译均在线粒体中进行。 DNA不与组蛋白结合。 鱼类mtDNA 特征 1.分子较小 2.编码效率高 3.拷贝数多 4.进化速度快 5.解码体系简单 6.核质互作 7.异质性 8.多态性 9.母系遗传 To be continued... 线粒体基因组大小 mtDNA的UGA编码色氨酸，而非终止信号。其tRNA的通用性较强，22个tRNA可识别48个密码子。 3. mtDNA为母系遗传 2. mtDNA的遗传密码与通用密码不同 1. mtDNA具有半自主性 mtDNA的遗传学特征 4. mtDNA在有丝分裂和减数分裂间都要经过复制分离 5. mtDNA的杂质性与阈值效应 6. mtDNA的突变率和进化率极高 鱼类线粒体基因组研究热点 1、线粒体DNA与核基因的关系； 2、线粒体DNA在系统进化中的应用； 3、不同生物线粒体基因组的进化等； 4、动物线粒体基因组与变异； 6、线粒体DNA多态性应用。 Nuclear DNA vs. Mitochondrial DNA 研究现状 核基因与线粒体DNA关系 mtDNA转录、复制和翻译需要各种不同的核基因产物;而核基因产物表达的紊乱与mtDNA突变、线粒体蛋白质的生物合成等受到抑制均有关系。 细胞核对线粒体的调控 线粒体对细胞核:逆行调控 研究现状 鱼类线粒体DNA与进化 Hasegawa等研究认为，长臂猿、猩猩、大猩猩、黑猩猩和人类祖先分歧的时间分别是1330万，1 086万，367万和268万年。 Johnson W E等根据线粒体DNA追踪分析了山猫的进化；Bermingham E等讨论了热带淡水鱼与中美洲鱼的起源和进化；Hanni C等根据线粒体DNA研究了洞穴熊的起源。 动物线粒体基因组的进化 通过进化分析发现一些无线粒体的动物曾经历拥有线粒体的时期。这一事实造成人们对广为接受的内共生进化学说新的理解。 线粒体DNA被视为按自身进化速率发展的小型基因组，广泛地接受为系统发生和群体进化研究的标记(marker)。 不同生物线粒体基因组组成排列方式(包括基因相对位置，控制区结构)对于亲缘关系较远的系统发生学和群体遗传学研究极有意义。 研究现状 研究现状 动物线粒体基因组与变异 控制区串联重复元件的变异 基因重复 基因重叠与基因间隔区大小的差异 基因缺失和增加 研究现状 线粒体DNA多态性与主要检测方法 mtDNA序列多态性的主要表现形式是点突变，多数为碱基转换，少数是颠换，其次还有碱基的插入或缺失等。 目前检验mtDNA序列多态性的方法较多，如变性梯度凝胶电泳、寡核苷酸连接分析、异源双链分析、变性高效液相色谱、固相微测序、等位基因特异性PCR等。 线粒体DNA序列分析技术的应用 线粒体疾病的诊断与分析 分子进化系统发生学的研究 检测自然界的杂交渐渗现象 分子生物地理学的研究 在保护生物学中的应用 研究现状 线粒体基因组最新进展 线粒体基因组的选择压力与动物运动能力相关 中科院昆明动物所张亚平院士课题组与“百人计划”施鹏研究员合作，在权威杂志《Genome Research》在线版发表研究性文章，揭示线粒体基因组的选择压力与动物的运动的关联。 该研究揭示了动物系统发育研究中最流行的标记——线粒体基因组的进化并非传统认为的中性进化，物种运动功能相对应的能量需求对线粒体基因组的进化有很重要影响，因为线粒体在能量代谢过程中起关键作用。 线粒体基因组最新进展 线粒体蛋白的选择压力与动物的能量需求有关 在张亚平院士和沈永义副研究员的指导下，博士研究生孙艳波对Genba