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Cloning vectors Cloning vectors plasmids bacteriophages Cosmid BAC,YAC animal and plant viruses baculovirus ,retroviruses 质粒 2-200kb 发现:细菌,偶见于链霉菌和酵母 独立于染色体之外进行复制和遗传,又依赖于宿主编码的酶和蛋白质来进行复制和转录。 比病毒还简单的亚细胞结构,一旦离开寄主细胞则无法繁殖。 Be capable of vectors Replicated and isolated independently of the host’s genome exprsssion vectors: strong promoters selectable marker. 理化因子消除 丫淀橙、EB、利福平、丝裂霉素C、亚硝基胍、高温、紫外线 消除作用不是药物对质粒DNA的破坏,而是对DNA复制的抑制 质粒消除常自发地发生 生物学方法:原生质体形成和再生 理化因子对高度稳定的质粒消除不易奏效 用溶菌酶处理等形成原生质体,再生后菌株便以很高的频率(94%)消除了质粒,如葡萄球菌、枯草杆菌、链霉菌、沙门氏菌等。 消除机制尚不清楚,有人认为去壁形成原生质体时导致了质粒消除,另有认为质粒在原生质体再生过程中丢失的。 质粒载体的设计 双抗生素 蓝白斑筛选 多克隆位点 表达载体 质粒载体多种用途 转录、测序、亚克隆、表达 转化E.coli容易,可重复性高 容易大量分离提纯 质粒载体筛选方法 插入失活 α-互补:IPTG,X-GAL 直接筛选:抗生素 表达筛选(抗体筛选) Probe筛选 质粒载体缺点 CaCl2转化效率低 克隆片段小于10kb 大量筛选时需要细胞裂解 Cosmid vector 带有cos位点的质粒载体 4-6kb,带有选择标记,在构建cDNA文库中很有用。 可携带大的外源DNA片段,克隆 45kb真核基因。 Phasmid载体 含有?噬菌体att位点(插入位点)的质粒。 含有质粒的ori和?噬菌体的ori。 CaMV克隆载体 含1个约8kb的环状双链DNA分子; 用于十字花科和少数非十字花科的植物基因转移; 其感染对植物有害,不能直接做载体; CaMV的DNA在植物细胞中能高水平转录35S RNA,其启动子是一强启动子。构建的含35S启动子的系列克隆载体可在植物细胞内高效表达基因。 反转录病毒克隆载体 反转录病毒是一类含RNA的病毒,进入受体细胞后,RNA反转录成DNA,通过两端由数百bp组成的长末端重复序列,整合到染色体上,成为原病毒。 只要将外源目的基因组入原病毒DNA的合适克隆位点,就能在感染的动物细胞中表达。 * 质粒特性: 携带编码多种基因:医学、农业、工业、 环境 细菌进化的重要因子 可以在种内或种间转移 生命和非生命的分水岭:既没有蛋白质外壳,又没有生命外细胞周期,比病毒更简单的原始生命形态,探索生命起源的重要基石。 As important tools: easy to isolate easy to manipulate and transformate in vitro development for DNA clone method to express foreign genes in prokaryotes and eukaryotes 质粒的表型效应 致育性 1946年,Lederbeger发现大肠杆菌有性生殖,F质粒或性质粒(sexplasmid) 接合作用(conjugation)说明了“自然界存在着天然的基因工程。 绿脓杆菌、抗药性因子(R因子)、大肠杆菌素因子和樟脑分解质粒、放线菌Scp1质粒 产生抗菌物质和毒素 col(大肠杆菌素因子): 大肠杆菌素--蛋白质性质的抗菌物质; 大肠杆菌、索氏志贺氏菌、葡萄球菌 pGKL1和pGKL2:线型DNA质粒,致死效应 乳酸克鲁维酵母 scp1:产生抗生素 编码毒素: 产毒素大肠杆菌(人类和动物腹泻); 金黄色葡萄球菌(烫伤皮肤综合症); Bt 对药物和重金属离子抗性 R因子 R1质粒(94kb) 使宿主对氯霉(Cm)、链霉素(Sm)、磺胺(Su)、氨苄(Ap)和卡那霉素(Km)抗性 对金属离子抗性 碲 (Te+6)、砷 (As3+)、汞 (Hg2+)、镍(Ni2+)、钴(Co2+)、银(Ag+)、镉(Cd2+)等 利用异常营养物 Pseudomonas、克氏杆菌、短黄杆菌等 将许多化学毒物降解。 降解酶由降解性质粒编码 特殊
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