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PCR出现假阴性原因分析及解决方案 反应体积的改变: 做小体积PCR后,再做大体积时,一定要重新摸索条件,而非简单地将反应体系中的各个成分加大几倍,否则易失败。 目 录 PCR技术历史 PCR的原理 PCR的反应体系和方法 PCR的类型和应用 PCR技术简史 DNA的复制 核酸体外扩增的设想 聚合酶链反应的发明 ATCGCGATAGCGTAGCTGCGACCTAGC 5’ 3’ TAGCGCTATCGCATCGACGCTGGATCG 3’ 5’ 解旋酶 解链酶 DNA 解旋解链 合成引物 子链延长 PCR技术简史 DNA的复制 核酸体外扩增的设想 聚合酶链反应的发明 ATCGCGATAGCGTAGCTGCGACCTAGC 5’ 3’ TAGCGCTATCGCATCGACGCTGGATCG 3’ 5’ DNA 解旋解链 合成引物 子链延长 GGAUCG 5‘ AUCGCG 5‘ 引物酶 引物酶 RNA引物 RNA引物 PCR技术简史 DNA的复制 核酸体外扩增的设想 聚合酶链反应的发明 ATCGCGATAGCGTAGCTGCGACCTAGC 5’ 3’ TAGCGCTATCGCATCGACGCTGGATCG 3’ 5’ DNA 解旋解链 合成引物 子链延长 GGAUCG 5‘ AUCGCG 5‘ TAGCGCTATCGCATCGACGCT 3’ ATAGCGTAGCTGCGAGGATCG 3’ DNA 聚合酶 DNA 聚合酶 PCR技术简史 DNA的复制 核酸体外扩增的设想 聚合酶链反应的发明 1971年,Khorana提出:经过DNA变性,与合适引物杂交,用DNA聚合酶延伸引物,并不断重复该过程便可克隆tRNA基因。 但由于测序和引物合成的困难,以及70年代基因工程技术的发明使克隆基因成为可能,所以,Khorana的设想被人们遗忘了…… PCR技术简史 DNA的复制 核酸体外扩增的设想 聚合酶链反应的发明 1985年,美国PE-Cetus公司的Mullis等人发明了聚合酶链反应(PCR) 基本原理是在试管中模拟细胞内的DNA复制 最初采用E-coli DNA聚合酶进行PCR,由于该酶不耐热,使这一过程耗时,费力,且易出错 耐热DNA聚合酶的应用使得PCR能高效率的进行,随后PE-Cetus公司推出了第一台PCR自动化热循环仪 1993年,Mullis等因此项技术获诺贝尔化学奖 PCR技术简介-定义 PCR: polymerase chain reaction 聚合酶链式反应 PCR技术是一种体外模拟自然DNA复制过程的核酸扩增技术,亦称为无细胞分子克隆技术。它是以待扩增的两条DNA链为模板,在一对人工合成的寡核苷酸引物的介导下,通过耐高温DNA聚合酶的酶促作用,快速特异地扩增出特定的DNA片断。 简单的讲, PCR技术即通过引物延伸核酸的某个区域而进行的重复双向DNA合成。 PCR扩增产物可分为长产物片段和短产物片段两部分。短产物片段的长度严格地限定在两个引物链5端之间,是需要扩增的特定片段。短产物片段和长产物片段是由于引物所结合的模板不一样而形成的,以一个原始模板为例,在第一个反应周期中,以两条互补的DNA为模板,引物是从3端开始延伸,其5端是固定的,3端则没有固定的止点,长短不一,这就是“长产物片段”。进入第二周期后,引物除与原始模板结合外,还要同新合成的链(即“长产物片段”)结合。引物在与新链结合时,由于新链模板的5端序列是固定的,这就等于这次延伸的片段3端被固定了止点,保证了新片段的起点和止点都限定于引物扩增序列以内、形成长短一致的“短产物片段”。不难看出“短产物片段”是按指数倍数增加,而“长产物片段”则以算术倍数增加,几乎可以忽略不计,这使得PCR的反应产物不需要再纯化,就能保证足够纯DNA片段供分析与检测用。 PCR技术简介 PCR反应所用酶: 早期的PCR方法采用大肠杆菌DNA聚合酶I的Klenow片断催化退火的寡核苷酸引物进行延伸反应。由于该酶会在进行DNA变性的温度下失活,所以在每一轮合成反应中都须重新加1份酶。并且在扩增较长模板是效果不够理想,产率较低,有一些错配,导致产物大小不均一。 耐热DNA聚合酶是从一种嗜热细菌-嗜热水生菌种提纯出来的,经95℃持续温育仍有活性,不会在加热变性中失活,故无需每轮反应都重新加酶,又由于寡核苷酸引物的退火和变性可以在更高温度下进行,使引物和模板间的误配大大减少,提高了扩增反应的特异性和产率,并且可以扩增更长的产物。 Taq DNA聚合酶(
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