鲤鱼微卫星分子标记的筛选与其在遗传连锁图谱上的定位.pdfVIP

鲤鱼戳IJ厦讣丁标记的fi蕃斌及萁轴：遗f{连馈翔讲上的定位 第一章微卫星分子标记及其在水产上的应用 遗传标记的发展经历丁3个阶段：即形态学标记、蛋白质标’圮以及分子标记。分 子标记是DNA水’、j，的遗传标记，闲而更能真iE捣示}15个体之问的遗传差异。自20叶 amplifiedpolymorphicDNA，RAI’【)J、限制性¨段l-∈Jff多态性(restriction length fragment fragmentlength o polymorphism，AFLP)等”1121fIi足它们掷何较多的局限性，比如多态性较低、重复 性差、操作复杂吼及要使川放刖性同位素等等。冈此日前人们更加倾向于使用一种以 PCR技术为基础的分了标也．即微上厦(microsatellite)Pl。 微卫星足指以少数儿个核符酸(多数为1．6)为单位多次串联重复的DNA序列， mndom repeats，SSR)、短串联重复(short sequence 人们也称之为简单序列重复(simple length repeats，STR)或简单序列K皮多怂性(simplesequencepolymorphism，SSLP)㈨…。 相对于jii『面几种分了标“，微卫星县有多态性丰富、重复性稳定以及共显性等优点， 因此被应用到越米越多∞领域如遗传病诊断、种质鉴定与保护、遗传作图以及法医学 等川【…IIIt”。本文下而将着重介绍微卫星的发展简史、特点、分析方法及其在水产111的 应J1]，jl：对其存在的一i足和发展前最提出一些焉法。 l微卫星简介 重复序列，这是最早发现的馓卫星H 的内含子qt也发现r一个重复25玖的7rG序列．并指“{这一序列在人及其它真核生物 ZDM 的基因组一}，广泛存在，‘j 及以3核骨酸、4核什酸为}袅心序列的多态性纯点也棚继被发现汨¨…。但是当时…于 检测手段仍局限仡杂交检驯的水i川：，这一炎’诅序列作为分了标记井术引起太火重视 技术使得微卫星标记多态性的检测变得快速简单，甚至趋于自动化，因而在很短的时 间内就引起了分子遗传学界高度重视。 微卫星的组成多以两个恢f_j：酸为重复单位，其中又以(cA)n或(GT)rl居多。以 3个、4个或更多核苷酸为重复单位的微卫星数景嗣l对较少，但它们的种类较多．比如 以3个、4个核苷酸为重复单他的微卫星分别柯：j2和128利，，因此它们的总数也是很 可观的，而|l这些微卫星的多态性较高，【，cR扩增的效果也更好一些，目前使用也较 普遍，只不过在筛选这些微卫星费时会更多，T作黾更大“…。另外．微卫星还可以分 为完美型、非完美戳利混台型王类。完美型是指做卫星序列完全是由单一的重复单位 首尾串联而成，小问没有问隔序列，这类微卫星要，i总数的一?仁以上。非完荧型的微 ● 卫星指在单～重复单位构成们拨心序列r|Jn，j，被一些较短的插入序列所中断。而混合 碰则是111两种或两种以}：的重复单位组成的微卫星。完美型微卫星的重复次数容易计 1