梅里埃质谱建库规则.pptVIP

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2019-08-16 发布于安徽
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梅里埃质谱建库规则.ppt

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数据库及算法的构建思路裴子建 2016年1月19日梅里埃Vitek MS数据库构建的独特概念基于种群基于菌株以种群代表的种属可发现种属特异性的特点需要许多参考菌株以个别菌株代表的种属快速构建数据库不需代表典型菌株 3 质数据库构建思路明显，稳定数据库 1046 菌种 13,790以上分离株 (数据库里的菌株) 29,873 以上图谱平均每个菌种有18菌株平均每个菌种有40个图谱 1,500 菌种 9,620分离株 (数据库里的菌株) 18,808 图谱平均每个菌种有8菌株平均每个菌种有16个图谱 VITEK MS IVD 56 菌种 25 菌株 25 菌种 100 菌株金黄色酿脓葡萄球菌 (S aureus) : 328株大肠埃希氏菌 (E coli) : 475株白念珠菌 (C albicans) : 133株肺炎链球菌 (S pneumoniae) : 306株 5 VITEK® MS IVD 临床数据库与算法 Advanced Spectra Classifier 6 专家图谱鉴别器(ASC) 分析原理权重矩阵分析 ASC的使用：建立数据库鉴定样本的图谱特点：没有图谱比较软件里没有内建图谱, 只有分析蛋白矩阵重量计算时间更快 14 7 每一个专家图谱鉴别器包含两个部分菌种特定权重矩阵菌种特定的分析功能:计算分析样本与权重矩阵的相似百分比专家图谱鉴别器(ASC) 8 菌株库建立原理质量区间分布顶峰 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 …………………………. ..…. 1298 1299 1300 区间 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ……………… S1 S2 S3 S1 S2 S3 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ……………… + + + + + + + + + + + + + 显示 / 未显示 9 菌株库权重矩阵发展 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 …… 1300 S pneumoniae (306 isolates) + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 …… 1300 E coli (475 isolates) + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - + 1 2 3 4 ………… 306 1 2 3 4 …… 475 肺炎链球菌大肠杆菌 10 S. pneumoniae S. pneumoniae S. aureus