第二讲蛋白质化学.pptVIP

* 平行β-折叠比反平行β-折叠更规则，平行折叠一般是大结构，少于5个链的很少见。反平行折叠可以少到仅由两条链构成。球状蛋白中平行与反平行几乎同样广泛存在。 * * * 转角I的特点是：第1个氨基酸残基羰基氧与第4个残基的酰胺氢之间形成氢键；转角II的第3个残基往往是甘氨酸。这两种转角中的第2个残基大都是脯氨酸。 在β－转角中第一个残基的C=O与第四个残基的N-H氢键键合形成一个紧密的环,使β－转角成为比较稳定的结构,多处在蛋白质分子的表面,在这里改变多肽链方向的阻力比较小。β－转角的特定构象在一定程度上取决与他的组成氨基酸,某些氨基酸如脯氨酸和甘氨酸经常存在其中,由于甘氨酸缺少侧链(只有一个H),在β－转角中能很好的调整其他残基的空间阻碍,因此使立体化学上最合适的氨基酸；而脯氨酸具有换装结构和固定的角,因此在一定程度上迫使β－转角形成,促使多台自身回折且这些回折有助于反平行β折叠片的形成。 * * * * * 结构域-单肽链内相对独立的结构、功能或折叠方式单位。有时候整条肽链称为一个结构域。 * * * * * 羰基中氧原子的电负性高于碳原子的电负性，故羰基有极性，氧原子具亲核性，碳原子具亲电性。由于羰基能够与水形成氢键，酮分子比羰基置换成亚甲基的分子来说更易溶于水。酮一般只作氢键受体而不作为氢键供体，无法形成自身分子间的氢键，因而比具有类似分子量的醇和羧酸更具挥发性。酮类是常用