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                Enzyme
Oligo Sequence
Chain Length
% CE
2 hr
20 hr
AccI
GGTCGACC CGGTCGACCG CCGGTCGACCGG 
8 10 12
0 0 0
0 0 0
AflIII
CACATGTG CCACATGTGG CCCACATGTGGG
8 10 12
0 90 90
0 90 90
AscI
GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA
8 10 12
90 90 90
90 90 90
AvaI
CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA
8 10 12
50 90 90
90 90 90
BamHI
CGGATCCG CGGGATCCCG CGCGGATCCGCG
8 10 12
10 90 90
25 90 90
BglII
CAGATCTG GAAGATCTTC GGAAGATCTTCC
8 10 12
0 75 25
0 90 90
BssHII
GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA
8 10 12
0 0 50
0 0 90
BstEII
GGGT(A/T)ACCC
9
0
10
BstXI
AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
22 24 27
0 25 25
0 50 90
ClaI
CATCGATG GATCGATC CCATCGATGG CCCATCGATGGG
8 8 10 12
0 0 90 50
0 0 90 50
EcoRI
GGAATTCC CGGAATTCCG CCGGAATTCCGG
8 10 12
90 90 90
90 90 90
HaeIII
GGGGCCCC AGCGGCCGCT TTGCGGCCGCAA
8 10 12
90 90 90
90 90 90
HindIII
CAAGCTTG CCAAGCTTGG CCCAAGCTTGGG
8 10 12
0 0 10
0 0 75
KpnI
GGGTACCC GGGGTACCCC CGGGGTACCCCG
8 10 12
0 90 90
0 90 90
MluI
GACGCGTC CGACGCGTCG
8 10
0 25
0 50
NcoI
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8 14
0 50
0 75
NdeI
CCATATGG CCCATATGGG CGCCATATGGCG GGGTTTCATATGAAACCC GGAATTCCATATGGAATTCC GGGAATTCCATATGGAATTCCC
8 10 12 18 20 22
0 0 0 0 75 75
0 0 0 0 90 90
NheI
GGCTAGCC CGGCTAGCCG CTAGCTAGCTAG
8 10 12
0 10 10
0 25 50
NotI
TTGCGGCCGCAA ATTTGCGGCCGCTTTA AAATATGCGGCCGCTATAAA ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA
12 16 20 24 28
0 10 10 25 25
0 10 10 90 90
NsiI
TGCATGCATGCA CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT
12 22
10 90
90 90
PacI
TTAATTAA GTTAATTAAC CCTTAATTAAGG
8 10 12
0 0 0
0 25 90
PmeI
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PstI
GCTGCAGC TGCACTGCAGTGCA AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
8 14 22 24 26
0 10 90 90 0
0 10 90 90 0
PvuI
CCGATCGG ATCGATCGAT TCGCGATCGCG
                
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