第9章 催化策略刘建华).pptVIP

其他种类的肽水解酶:天冬氨酸蛋白酶 天冬氨酸蛋白酶活性位点中心有一对天冬氨酸，联合作用活化水分子，后者攻击肽键。一个天冬氨酸去质子，攻击水分子（使之脱去质子）。另一个天冬氨酸有质子，极化肽键使肽键对亲核攻击敏感。这类蛋白酶包括肾素 ，HIV蛋白酶。 活性位点有金属离子（几乎都是锌离子）。金属离子活化水分子，后者亲核攻击肽键的羰基。嗜热细菌蛋白酶（thermolysin）和消化酶羧肽酶A是锌离子蛋白酶。嗜热菌蛋白酶是锌蛋白酶家族成员。这个家族很大，包括基质金属蛋白酶（负责组织重构和组织降解）。但是羧肽酶A不属于这一家族。 其他种类的肽水解酶: 金属蛋白酶 讲到此. 图9.19 HIV蛋白酶是二聚体 天冬氨酸蛋白酶 。两个亚基完全相同（分别用蓝色和黄色表示）。每个亚基（有99个氨基酸）给活性位点提供一个Asp。底物结合后关闭结合口袋的扇翼结构。 图9.20 Indinavir 是HIV蛋白酶抑制剂。Indinavir (crixivan)的结构与HIV蛋白酶底物多肽的结构比较。底物断裂化学键用红色标出。 Indinavir 的醇与四面体中间物很相似，其它基团与酶分子识别位点S2, S1, S1’,和S2’结合。在活性位点，indinavir采用的构型接近于酶蛋白的二重对称结构。结合抑制剂后可变翼盖住HIV蛋白酶活性位点。 抑制剂中心醇羟基与活性位点两个Asp相互