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第十章 核酸的代谢 第二节 DNA的生物合成 核酸是生命遗传信息的携带者和传递者 一、参与DNA复制的酶及蛋白因子 (一) DNA聚合酶(DNA polymerase, DNA pol) 以dNTP为底物,以DNA为模板,需要一段引物,从 引物的3-OH末端合成DNA新链。 三种大肠杆菌DNA聚合酶 1. DNA聚合酶I(1956,Arthur Kornberg) 外切酶活性:3′ 5′外切活性具有校正作用; 5′ 3′切除引物和DNA损伤的修复; 聚合作用:合成速度较慢,每秒10个核苷酸,而且新 链长20个核苷酸后,酶即脱离模板。 2. DNA聚合酶Ⅱ 外切酶活性:3′ 5′外切活性 聚合作用: 5′ 3′补小缺口(100核苷酸) 3. DNA聚合酶III 大分子寡聚酶,10种22个亚基组成。每种亚基都有2个,整个分子形成一个不对称的二聚体 DNA聚合酶Ⅰ 多功能酶 5’ 3’外切酶 3’ 5’外切酶 5’ 3’聚合酶 单链多肽(Zn2+) 大小二个片段 切除RNA引物, 填补空缺 损伤后修复 DNA聚合酶Ⅲ 多功能酶 5’ 3’聚合酶 3’ 5’外切酶 不对称二聚体 单体1-前导链/单体2-随从链 DNA复制的主要酶 高续进性 高聚合酶活性 高产物真实性 真核细胞DNA聚合酶 哺乳动物中已发现5种 DNA pol α、β、γ、δ、ε polα和δ——新链的延长 Polβ——DNA的重组修复 polγ——线粒体的复制,还具3’ 5’ 外切活性 Polε——聚合作用和3’ 5’ 外切活性 (二)DNA连接酶(DNA ligase) DNA双螺旋中一条链有缺口,并且3’-OH与5’-P相邻 特异性不高, 在DNA不连续复制、重组及损伤修复中起作用 哺乳动物:ATP辅酶,大肠杆菌:NAD辅酶,都需要Mg2+ 连接方式:酶先与ATP或NAD形成酶—AMP,酶—AMP与5’-P形成焦磷酸而活化 (三)与解除DNA高级结构有关的酶与蛋白因子 1.拓扑异构酶 拓扑性质—物体或图像做弹性移动时保持物体图像不 变的性质。DNA三级结构具有拓扑性质。 Ⅰ型酶:使一定部位的一条链切口-封口反应 Ⅱ型酶:DNA两条链同时发生切口-封口反应 Ⅱ型酶还可使DNA形成超螺旋 (三)与解除DNA高级结构有关的酶与蛋白因子 2.解螺旋酶 依赖DNA单链存在,对单链亲和力强 大肠杆菌中发现多种与解除螺旋结构有关的蛋白质DnaA,DnaB,DnaC协同作用,解开DNA。 (三)与解除DNA高级结构有关的酶与蛋白因子 3.单链结合蛋白(SSB) —与解开的DNA单链结合后,两条DNA链就不能形成双螺旋; —还可以防止核酸酶的降解; —原核生物中SSB与DNA单链结合表现正协同效应。 (三)与解除DNA高级结构有关的酶与蛋白因子 4.引发酶(primase) 多数以RNA片段为引物,也存在DNA片段引物、tRNA引物 ——促进引物合成的酶称为引发酶 (三)RNA引物 DNA聚合酶 不能催化两个游离dNTP在DNA模板上聚合 需要具3’-OH的引物 RNA聚合酶 能催化两个游离NTP在DNA模板上聚合 提供3’-OH 引物最后被DNA聚合酶Ⅰ除去、补满,再由连接酶连接 二、DNA的复制 1、半保留复制方式 通过DNA复制形成的新DNA分子, 与原来的DNA分子完全相同。 经过一个 复制周期后,子代DNA分子的两条链中,一条来自亲代DNA分子,另一条是新合成的,所以又称为半保留复制。 2.DNA半不连续复制 至今发现的DNA聚合酶只能催化从模板的3′端向5′端前进的反应。 冈崎(1968)等人的实验: 用噬菌体T4感染的大肠杆菌作为实验材料,以3H标记的胸苷合成DNA.短时间内测定同位素的掺入情况。 实验结果:短时间(2S)标记出现在分子质量较小的片段,只有在标记时间长(30S以上)才出现在分子质量较大的片段。 冈崎片段——DNA合成是不连续的,先合成一些DNA小片段,其大小约含1000-2000个核苷酸残基,然后再通过 DNA连接酶将它连接起来。 二、DNA的复制 3、DNA的复制过程 (1)合成起始 a.辨认起始点 DNA复制有固定的起始点。 大肠杆菌:OriC含245bp,有两个区域起关键作用,4个9核苷酸重复序列;3个13核苷酸重复序列(富含AT)。 二、DNA的复制 b.模板DNA解除高级结构 dnaA蛋白与起始点形成复合物,促进其他dna蛋白也与起始点形成复合物。一旦双螺旋解开成单链,SSB即结合单链。 TopoⅡ在打
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