生物信息学第六章.pptxVIP

第六章 蛋白质结构本章内容6.1 蛋白质结构6.2 蛋白质结构数据库和结构可视化6.3 蛋白质结构分析 6.4 蛋白质结构预测6.1 蛋白质结构蛋白质分子是由氨基酸首尾相连而成的共价多肽链，但是天然的蛋白质分子并不是松散的多肽链，每一种蛋白质都有自己特殊的空间结构，这种空间结构通常也被称为蛋白质的构象。一个给定的蛋白质理论上可以采用多种构象，但在天然的生理环境下，只有一种或很少几种是能够稳定存在的。蛋白质结构四个层次一级结构（primary structure）是指氨基酸序列，描述了蛋白质的氨基酸组成，也被称为多肽链；二级结构（secondary structure）是指多肽链借助氢键排列成特殊的α螺旋和β折叠片段，它们在蛋白质中会重复出现，且进化过程非常保守；三级结构（tertiary structure）是指多肽链借助各种非共价键（或者非共价力）弯曲、折叠而成的结构，蛋白质的三级结构描述出了每个原子在三维空间中的位置，三级结构也被称为三维结构或空间结构，在没有特别指明的情况下，本章中所提及的蛋白质结构就是指蛋白质的三级结构；四级结构（quaternary structure）是指寡聚蛋白质依靠非共价键结合形成的聚合体，在许多情况下，寡聚蛋白质并没有生物学功能，它必须和其它蛋白质聚合才能行使功能,这种复杂构型被称为蛋白质的四级结构。6.2 蛋白质结构数据库和结构可视