基因组序列的功能.pptVIP

第一节 在基因组中识别基因;（2）ORF的平均长度;在真核生物中不能直接寻找ORF的原因：;（3）对 ORF扫描软件的修正;4）寻找同源序列 ;2. 通过实验技术识别基因;（1）核酸杂交实验;2）zoo-blot (garden blot）;（2） cDNA 测序;RACE;（3） 寻找外显子-内含子边界.;二、确定某个基因的功能;（2）同源性分析揭示基因或片断的功能;2）部分序列分析;（3）同源性分析在酵母基因组计划中的应用 ; 2. 用实验确定基因功能;酵母的删除盒;基因敲除（knock out）小鼠; 2）非同源重组的基因失活;人工诱导转座：;2）RNA干涉（RNA interference）;缺点：在哺乳动物中只能对单细胞进行处理，因为RNA在体内的存在时间有限。 ;（2） 通过基因超表达分析基因功能;3. 未知基因编码的蛋白质功能的精细研究;1）寡核苷酸定点突变;2）同源重组导入突变基因 ;（2）报告基因（Reporter genes）和免疫组织化学;1）报告基因;研究不同组织的不同发育阶段、不同疾病的转录物和翻译产物;1. 研究转录物组;基因表达系列分析(SAGE);（2） 基因芯片;2. 研究蛋白质组;② 质谱;;（2）鉴定蛋白质的相互作用;;② 酵母双杂交系统;（3）蛋白质相互作用图;The yeast protein interaction map.