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你与你身上的微生物 人类是什么？ 如果有人向你提出这个奇怪的问题，你也许会不 假思索地回答：人类就是人呀！然而生物学家会告诉 你，我们人类，就是人与寄存在人体躯壳内的大量微 生物共生的一个小小的生态系统。 通过基因测序研究人体微生物 早在300多年前，显微镜被发明后不久，科学家 已观察到人体内存在微生物。然而，由于检测、分析 技术等的限制，人们无法大规模地获取人体微生物群 的构成、功能等详细信息，更无法进一步了解这些数 量庞大的微生物群与人体是如何相互作用的。 从人类基因组的破译开始，人们才真正对这些微 生物有了比较深入的了解。2000年6月26 0,当美 国总统克林顿与英国首相布莱尔共同宣布人类基因组 计划工作草图完成时，整个世界都为之轰动。围绕着 破译“生命密码”的研究，引起公众的广泛关注和讨 论。很多人曾认为，只要读懂人类基因组代表的“生 命密码”，人类的所有健康问题将会迎刃而解。然而, 越来越多的科学家发现，人体除受自身基因的调控外, 还受到人身上大量的共生细菌的影响。 2007年底，美国国立卫生研究院正式启动为期5 年的“人类微生物组计划”，共投入经费1.4亿美元。 该计划是继“人类基因组计划”完成之后一项规模更 大的DNA测序计划，也被称为“人类第二基因组计划”。 其目标是探索研究人类微生物组的可行性。通过绘制 人体不同器官中微生物元基因组图谱（包括细菌、病 毒等微生物），解析微生物群结构变化对人类健康的影 响。同时，为其他科学研究提供信息和技术支持。我 国作为参与者也一直积极推动初期研究工作。 欧盟也有类似的研究项目，例如，作为人类元基 因组第七框架项目的子项目，人类肠道宏基因组计划 就主要研究人类肠道中的所有微生物群落，进而了解 人肠道中细菌的物种分布，最终为后续研究肠道微生 物与人的肥胖、肠炎等疾病的关系提供非常重要的理 论依据。中国深圳华大基因研究院承担了该计划中的 200多个欧洲人肠道微生物样品的测序及后续生物信 息分析工作。 这一系列研究项目正在揭开人体微生物神秘的面 纱。例如，研究发现肠道菌群结构的改变与失衡除了 会导致肠道疾病外，还与糖尿病、肥胖等很多慢性全 身性代谢性疾病有密切关系，甚至还与癌症有关。微 生物甚至还影响着机体免疫系统的发育成熟。越来越 多的研究提示，人类健康与人体微生物息息相关，随 着人体与微生物之间的关系不断得到阐明，人们对于 人体本身的认识、对于健康和疾病的认识以及医疗模 式都有可能随之发生根本的改变。 研究发现微生物与人体健康息息相关 2010年3月4日，欧盟于2008年1月1日启动 的人类肠道宏基因组计划的研究小组公布阶段性重大 成果，引起世界的关注。该项研究成果收集了 124个 来自于欧洲人肠道菌群的样本，釆用了新一代大规模 高通量的测序技术进行深度测序，产出近6千亿的碱 基序列。经过序列组装和基因注释分析，从中获得330 万个非冗余的人体肠道宏基因组的参考基因，大概是 人自身基因的150倍。这个基因集中包含了绝大部分 目前已知的人体肠道微生物基因，但更多的是目前未 知微生物的基因。从这个基因集中可以估计人肠道中 存在1000种至1150种细菌，平均每个人体内含有约 160种优势菌种，并且这些细菌是绝大部分个体所共 有的。也就是说，我们每个活着的人体内都有大约100 万亿个微生物细胞，总重量约1.5千克。微生物细胞 的数量是人体细胞的10倍，在人体的独特基因中占 99.9%o它们的构成在很大程度上决定着人体的运转以 及机能正常或失常。 美国人类微生物组计划在2012年集中公布了第 一批研究数据，来自多个国家的超过200名科研人员 报道了他们5年来的研究成果。他们分析了 242个美 国健康志愿者微生物基因组，获得了近800个菌种的 基因参考序列。他们发现，来自牙齿和粪便的微生物 样本其类型和遗传多样性是最强的;来自皮肤和脸颊 内侧样本的多样性次之;而来自阴道样本的多样性是 最低的。 科学家们还发现，不同国家人群中的肠道微生物 存在很多差异，差异最显著的是微生物的多样性程度。 例如，印第安人和马拉维人的肠道微生物组比美国人 的肠道微生物具有更大的多样性。有观点认为，微生 物多样性程度越高，人体越健康。该研究还发现，尽 管来自三种不同地域人群的肠道微生物组存在很多差 异，但它们之间也存在惊人的相似性。例如，三个不 同国家的婴儿微生物组形成过程具有共同的模式，即 婴儿需要6个月至9个月的时间来获得第一组600? 700个细菌，然后再经过几年的时间才能获得成人的 微生物组。该研究还发现了一个非常有趣的现象，即 肠道微生物组的构成会随年龄增长而发生改变，而这 一变化恰恰适应了不同年龄段人体的需求。 同时，人体微生物还与免疫系统有着密切的关系。 2012年4月，日本科学家在《科学》报