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Jmol使用方法说明
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All
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Protein
All
选择蛋白质全部
Backbone
选择蛋白质主干
Side Chains
选择蛋白质侧链
Polar Residues
选择蛋白质的极性残基
Nonpolar Residues
选择蛋白质的非极性残基
Basic Residues(+)
选择蛋白质的碱性残基
Acidic Residues(-)
选择蛋白质的酸性残基
Uncharged Residues
选择蛋白质的无电荷残基
By Residue Name
通过残基名进行选择
Nucleic
All
选择所有核酸
Backbone
选择核酸主干
Bases
选择碱基
DNA
选择脱氧核糖核酸
RNA
选择核糖核酸
A
选择腺嘌呤
C
选择胞嘧啶
G
选择鸟嘌呤
T
选择胸腺嘧啶
U
选择尿嘧啶
AT Pairs
选择腺嘌呤胸腺嘧啶对儿
AU Pairs
选择腺嘌呤尿嘧啶对儿
GC Pairs
选择鸟嘌呤胞嘧啶对儿
Hetero
All
选择所有杂原子
Solvent
?选择溶剂
Water
选择水分子
Except Solvent
排除溶剂
Except Water
排除水分子
Ligand
选择配体
Other
Carbohydrate
选择糖类
Lipid
选择脂类
Other
其它
Element
Carbon
选择碳元素
Hydrogen
选择氢元素
Oxygen
选择氧元素?
Nitrogen
选择氮元素
Phosphorus
选择磷元素?
Sulphur
选择硫元素
Model
All Models
选择所有模型
Frame
All Frames
选择所有框架
?????? Invert Selection????????????
逆转选择
?????? Display Selected Only?
只显示选择的部分
Render
Scheme
CPK Spacefill
显示CPK空间填充
Ball and Stick
显示球和棒结构
Sticks?
显示棒结构
Wireframe?
显示键的大小
Atoms
Off
不显示的范德华半径
15%Vanderwaals
显示15%的范德华半径
20%Vanderwaals
显示20%的范德华半径
25%Vanderwaals
显示25%的范德华半径
50%Vanderwaals
显示50%的范德华半径
75%Vanderwaals
显示75%的范德华半径
100%Vanderwaals
显示100%的范德华半径
Bonds
Off?
关闭键的显示
On?
打开键的显示
0.10埃
显示0.10埃的键长
0.15埃
显示0.15埃的键长
0.20埃
显示0.20埃的键长
0.25埃
显示0.25埃的键长
0.30埃
显示0.30埃的键长
Hydrogen Bonds
Off
关闭氢键的显示
On
打开氢键的显示
Set H-Bonds Side Chain??
设置氢键侧链
Set H-Bonds Backbone
设置氢键主干
0.10埃
显示0.10埃的氢键长
0.15埃
显示0.15埃的氢键长
0.20埃
显示0.20埃的氢键长
0.25埃
显示0.25埃的氢键长
0.30埃
显示0.30埃的氢键长
Disulfide Bonds
Off
关闭二硫键的显示
On
打开二硫键的显示
Set SS-Bonds Side Chain
设置二硫键侧链
Set SS-Bonds Backbone
设置二硫键主干
0.10埃
显示0.10埃的二硫键长
0.15埃
显示0.15埃的二硫键长
0.20埃
显示0.20埃的二硫键长
0.25埃
显示0.25埃的二硫键长
0.30埃
显示0.30埃的二硫键长
Structures
Off
关闭结构显示
Backbone
显示主干结构
Trace
显示轨迹结构
Cartoon
显示卡通结构
Ribbons
显示条带结构
Labels
None
不对任何原子进行标识
With Element Symbol
标识出元素符号
With Atom Name
标识原子名
With Atom Number
标识原子序列号
Position Label on Atom
Centered
使所有原子居中
Upper Right
使所有原子在右上角
Lower Right
使所有原子在右下角
Upper Left
使所有原子在左上角
Lower Left
使所有原子在左下角
Color
Atoms
By Scheme
Element (CPK)
以元素为单位对原子着色
Amino
以氨基为单位对原子着色
Secondary Structure
以二级结构为单位对原子着色
Chain
以链为单位对原
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