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喀什地区DNA数据库升级软件、硬件配置方案(400万库容)
DNA硬件服务器升级配置:(100-400万库容):
序号
配置说明
硬件配置(单台)
软件环境
厂商
配置
数量(台)
1
MIS
系统数据库服务器
2台
CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU
内存:16G以上
硬盘:1T x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10
网卡:1000M
操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP2 Enterprise Edition
DNA专业数据库
DELL
R730 E5-2640V4*2/32G/1T SAS *4/
DVD/H310/495W双电/导轨
2
2
MIS
系统应用服务器2台
CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU
内存:16G以上
硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10
网卡:1000M
操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP2 Enterprise Edition
配置比对引擎模块300万/秒
DELL
R730 E5-2640V4*2/64G/1T SAS *2/
DVD/H310/495W双电/导轨
2
3
LIMS
系统数据库服务器
1台
CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU
内存:16G以上
硬盘:1T x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10
网卡:1000M
操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP2 Enterprise Edition
DNA专业数据库
DELL
R730 E5-2640V4*2/32G/1T SAS *4/
DVD/H310/495W双电/导轨
2
4
LIMS
系统应用服务器1台
CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU
内存:16G以上
硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10
网卡:1000M
操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP2 Enterprise Edition
配置比对引擎模块300万/秒
DELL
R730 E5-2640V4*2/64G/1T SAS *2/
DVD/H310/495W双电/导轨
2
5
DIS比对
服务器5台
CPU:2颗8核2.4GHz以上CPU
内存:16G以上
硬盘:300G x 4 10K SAS,配置RAID5或RAID10
网卡:1000M
操作系统:Windows Server 2008 R2 64bit SP2 Enterprise Edition
配置比对引擎模块300万/秒
DELL
R730 E5-2640V4*2/64G/1T SAS *2/
DVD/H310/495W双电/导轨
6
合计
原服器数据校验、数据完整性备份、数据迁移、新服务器程序环境架设、新服务器程序性能调优
序号
内容
1
原服务器数据校验:数据完整性校验、上级数据同步校验、比中结果同步校验、数据格式合法性校验
2
原服务器数据备份:整库备份
3
数据迁移:原服务器数据完整性迁移至新服务器并且
4
新服务器程序环境架设:操作系统可行性验证、第三方软件辅助架设、新服务器程序架设
5
新服务器程序性能调优:第三方软件性能调优、解决用户实际使用操作等问题
原LIMS实验室管理系统升级
序号
内容
1
增加从检验鉴定系统中直接转移委托
2
增加多种新的鉴定方法
3
新的实验仪器投入使用,LIMS必须及时满足系统和测序仪的数据写入导出等要求
4
通过与系统身份证关联,对于待检验的血样,LIMS可以在检验前确定该血样所属个体是否已经检验建库过
5
实时异地备份数据、延迟3分钟
6
保证区县LIMS与此系统数据无差传输
7
DNA LIMS系统数据库(100万份)基础上扩容至300万份
8
核酸分析仪获取的常染色体图谱原始文件
9
核酸分析仪获取的Y染色体图谱原始文件
10
将核酸分析仪数据转换成可用于比对的格式
11
新增家系录入模块
12
家系的整合
13
Y染色体基因信息入库
14
个体识别比对速度提升至200万/秒(容差1对)
15
在比对方法中添加混合样本比对模式
16
可以对外来数据进行手工快速比对。
17
在原有的常染色体双倍体比对模式基础上增加Y-STR单倍体比对模式
18
分析FSA文件系统
19
分析HID文件系统
20
参考国家库二期数据结构,提升程序运行效率
21
针对海量实验室数据设计相关表结构
22
针对上报样品设计相关表结构
23
针对样品图谱等大数据设计相关表结构
24
混合样品模拟人为操作,实现样品分离多样化比对
25
实现自动从混合样品内提取可疑位点
DNA数据库优化硬件环境和软件配置建议
省级DNA实验室及其数据库
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