代谢组学许国旺课件.pptVIP

代谢组学-许国旺; “基因组学反映了什么是可以发生的，转录组学反映的是将要发生的，蛋白质组学指出了赖以发生的，只有代谢组学才真正反映业已发生的。” ——许国旺;第一章 代谢组学的简介 第二章 代谢组学的研究方法 第四章 代谢组学的应用 第五章 代谢组学的发展前景 ;组学时代4种最重要的组学;代谢组学（Metabonomics/ Metabolomics ）是通过考察生物体系（细胞、组织 或生物体）受刺激或扰动后（如将某个特定的基因变异或环境变化后），其代谢产物的变化或其随时间的变化，来研究生物体系的一门科学。 代谢组（metabolome）是基因组的下游产物也是最终产物，是一些参与生物体新陈代谢、维持生物体正常生长功能 和生长发育的小分子化合物的集合，主要是相对分子量小于1000的内源性小分子。 代谢物数量因物种不同而差异较大： 植物（200 000种）、动物（2500种）、微生物（1500种） ; 代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科，是系统生物学的重要组成部分。 基因组学和蛋白质组学分别从基因和蛋白质层面探寻生命的活动，而实际上细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的，如细胞信号释放（cell signaling），能量传递，细胞间通信等都是受代谢物调控的。代谢组学正是研究代谢组（metabolome）——在某一时刻细胞内所有代谢物的集合——的一门学科。基因与蛋白质的表达紧密相连，而代谢物则更多地反映了细胞所处的环境，这又与细胞的营养状态，药物和环境污染物的作用，以及其它外界因素的影响密切相关。 因此有人认为，“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生，而代谢组学则告诉你什么确实发生了。”（Bill Lasley, UC Davis）;1982;代谢组学的特点： 关注内源化合物 对生物体系的小分子化合物进行定量定性研究 上述化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、基因修饰或环境因子的影响 上述内源性化合物的知识可以被用于疾病的诊断和药物筛选 与转录组学和蛋白组学相比，代谢组学有以下优点： 基因与蛋白质表达的微小变化会在代谢物上得到放大，从而使检测更??易 代谢组学的研究不需要建立全基因测序及大量序列标签（EST）的数据库 代谢物的研究种类远小于蛋白质的数目 研究中采用的技术更通用; Genomics and Proteomics are not sufficient to describe reasons for toxicity or disease state 基因组学和蛋白组学对于毒性或疾病状态的描述是不足的 Neither Genomics nor Proteomics can produce time course information which is important for animal to animal comparison 基因组学和蛋白组学都不能提供动态信息，但这些信息对于动物间的比较是重要的 Metabolite profiling produces information on the biochemical pathways effected 代谢物分析能提供生化途径结果的信息 Monitoring metabolites allows concurrent or sequential affects to be monitored, e.g. blocking of a metabolic pathway in the liver can lead to toxicity in the brain (hydrazine) 代谢监控可监控即时或相继的结果，例如：阻断肝脏中代谢途径会在脑中产生毒性肼 Metabonomics, unlike the other “omics” is non-invasive 不像别的组学研究，代谢组学是无创的;代谢组学研究现状 代谢组学属于全局系统生物学（Global systems biology）研究方法，便于对复杂体系的整体进行认识．譬如，一个正常工作的人体包括“人体”本身和与之共同进化而来且共生的消化道微生物群体（或称菌群），孤立地研究“人体”本身的基因，转录子以及蛋白质当然可以为人们认识人体生物学提供重要信息，但无法提供使人体正常工作不可缺少的菌群的信息．人体血液和尿液的代谢组却携带着包括菌群在内的每一个细胞的信息，因此代谢组学方法对研究如人体这样复杂的进化杂合体十分有效．