第2章 基因组的结构与功能.ppt

第一节 真核生物基因组的结构与功能 一、真核生物染色质DNA的高级结构 1、DNA高级结构中的蛋白质 2、DNA与蛋白质的结合与染色体的组装 二、真核生物核基因组结构与功能特点 1、真核细胞基因组中结构基因的结构与功能特点 2、真核细胞基因组中的重复序列的结构与功能特点 3、多基因家族与假基因 三、真核生物线粒体基因组的结构 卫星DNA(Satellite DNA)类型 大卫星DNA:又叫经典卫星DNA 其功能目前尚不清. 小卫星DNA:重复单位长度9-24bp,长度呈高度可变性.它分可变数目串联重复序列(VNTRS)和端粒DNA两种.前者的核心序列为:GGGCAGGAXG;功能与同源重组有关.后者由(TTAGGG)n组成的2-20kb的DNA片段,功能是维持端粒稳定. 微卫星DNA:重复单位长1-6bp,重复10-60次;长度一般小于150bp,常见的是以(AC) n和(TG) n为重复单位.是一种很好的遗传标记. 高度重复序列A功能 1）参与复制水平的调节（常存在于复制起始区） 2）参与基因表达调控（可以转录到hnRNA中；有助于稳定RNA分子） 3）参与染色体配对（α卫星DNA分布着丝粒附近，即同源染色体之间的联会可能依赖特定的卫星DNA序列） 真核生物基因组结构特点 1，均为DNA， 体细胞基因组为二倍体。 2，基因数多，结构复杂，多个复制起始点。 3，转录产物为单顺反子，无操纵子结构。 4，非编码序列占基因组的90%以上。 5，有大量的重复序列。 6，大多数基因是断裂基因。 7，多基因家族，超基因家族。 第二节 原核生物基因组的结构与功能 一、原核生物染色体基因组的结构与功能 1、原核生物染色体DNA的基本结构与功能 2、原核生物染色体基因组中结构基因的基本结构 与功能特征 3、原核生物染色体基因组中结构基因与调控序列 的组织形式 二、原核生物中的质粒DNA 1、质粒的基本特征 2、质粒的遗传控制 3、质粒的类型 重叠基因有以下三种情况：1.一个基因完全在另一个基因里面。如基因Ｅ在基因Ｄ内,同样，基因Ａ和Ｂ是两个不同基因，而Ｂ包含在基因Ａ内。。2.部分重叠。如基因Ｋ和基因Ａ及Ｃ的一部分基因重叠。3.两个基因只有一个碱基重叠。如基因Ｄ的终止密码子的最后一个碱基是Ｊ基因起始密码子的第一个碱基(如TAATG)。 这些重叠基因尽管它们的DNA大部分相同，但是由于将mRNA翻译成蛋白质时的读框不一样，产生的蛋白质分子往往并不相同。有些重叠基因读框相同，只是起始部位不同，如SV40DNA基因组中，编码三个外壳蛋白VP1、VP2、VP3基因之间有122个碱基的重叠，但密码子的读框不一样。而小t抗原完全在大T抗原基因里面，它们有共同的起始密码子。 三、常见病毒的基因组结构与功能 HBV SV40 Poliovirus SARS H1N1 HIV HBV基因图 HBV正负链的形成 (二)SV40 猿猴空泡病毒40(Simian vacuolating virus 40, SV40)是迄今为止研究得最为详尽的乳多空病毒(Papova viruses)之一。SV40病毒的基因组是一种环形双链的DNA，其大小仅有5243bp，很适于基因操作。 猿猴空泡病毒40（SV40），是60年代初发现分离的猴肾细胞病毒，它是一种DNA病毒，其在体外可使人及动物多种组织类型正常细胞发生恶性转化，在转基因小鼠体内可诱发多种肿瘤形成，并且人类许多肿瘤的发生也与之有关。近年来，人们对SV40与人类肿瘤的关系进行了大量的研究。 保罗.伯格(Paul Berg,1926) 是基因工程的开拓者,与桑格(F.Sanger)和吉尔伯特(W.Gilbert)分享了1980年的诺贝尔化学奖.1983年获美国国家科学奖等奖;美国艺术和科学院院士,法国科学院院士. 1943年考取宾夕法尼亚大学,因战争而参加了海军. 1948年才获生化硕士学位,1952年获生化博士学位;随后在丹麦的哥本哈根的赫尔曼-卡尔卡(Herman Kalckar)教授实验室做博士后研究一年. 1954年到华盛顿大学跟随阿瑟-科恩伯格(Arthur Kornberg)从事癌症的研究,1959年升为副教授,然后到斯坦福大学工作,先后任副教授、教授,生化系主任等职. 从1959 年开始SV40的研究,在70年代初,将SV40的DNA插入噬菌体的DNA中,形成新的重组DNA分子. 1985年任斯坦福大学的贝克曼分子生物学与医学研究中心主任,2000年改任名誉主任和资深教授. SV40基因组结构 SV40 SV40 有趣的是，有些真核病毒的内含子或其中的一部分，对某一个基因来说