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植物生理学专题（六）植物生理与分子生物学 二、高等植物基因结构及表达调控 1、真核基因组结构特征 2、植 物 的 基 因 组 3、植 物基 因 的结构 4、植物基因的表达调控 ⑤ 真核生物能够根据生长发育阶段的需要进行DNA的重排和基因扩增。 2、植物的基因组 基 因 （gene）？ 基因组 （genome）？ 基因组学 （genomics）？ 基因组：一个生物遗传物质的总和。 细胞中的全部DNA。 2.1 植物基因组的复杂性 （2）植物基因组的长度差异是整个生物界最大的； 拟南芥单倍体基因组：6.3×107 bp； 百 合单倍体基因组：1.0×1011 bp； 叶绿体基因组（chloroplast genome）： 多数植物 cpDNA在120~160kb之间； 含有87~183个已知基因； 线粒体基因组（mitochondrial genome） 也有基因从核基因组转移至细胞器基因组: 核糖体L23蛋白质基因。 叶绿体、线粒起源：马古利斯的内共生理论 2.2 基因组学简介 基因的命名： 3 植物基因的结构 克隆植物中编码蛋白质基因的方法： ① 根据蛋白质测序结果，合成一段寡聚探针，从该植物的基因组文库与 cDNA (complementary DNA)文库中分别钓出编码该蛋白质的基因与 cDNA克隆。 ② 根据蛋白质测序结果，合成一对 PCR 引物，以植物总DNA为模板，扩增出目标基因片段，以此片段为探针，从基因组文库与 cDNA文库中分别钓出编码该蛋白质的基因与 cDNA克隆。 ③ 基因产物不明，但知道基因突变后的表型，可用转座子标签法分离基因。 ④ 利用RFLP图谱，找出与所要克隆基因紧密连锁的分子标记，用染色体步行法找到所要克隆的基因。 通过对比研究，表明植物基因结构与其它真核基因结构相似，主要由4个结构区域组成。 5’上游区、5’非翻译区、编码区、3’非翻译区 3.1 5’上游区: 转录起点5’端上游一段很长的区域，包含启动子在内的与基因表达起始和表达调控有关的许多元件。 ② 在上游 –32 ?7有一段TCACTATATAG一致顺序： 简称：TATA box。 该序列是RNA聚合酶II起始转录所必需的。 3.2 5’非翻译区: 转录起点到翻译起始密码子之间的序列。该序列 5’端是前体 mRNA 加帽位点。 3.3 编码区: 起始密码到终止密码之间的序列。有时专指外显子（extron）部分。 ① 多数植物基因转录本 5’ 有一个起始密码AUG，少数植物 5’ 有4个AUG。 翻译起点的共有序列： 植物：C（G）AANNATGG 动物：A（G）NNATGG 内含子共有4种，具有核酶性质： I 类内含子：主要存在于rRNA和质体tRNA基因 中，中间部分高度保守； II 类内含子：主要存在于线粒体和质体mRNA基 因中，拼接点的序列高度保守； III 类内含子：主要存在于核mRNA基因中； IV 类内含子：存在于核tRNA基因中； 3.4 3’非翻译区: 4 植物基因的表达调控 确定某种基因在何种组织专一表达的方法： ② Northern 原位杂交 ③ P2基因： 编码一种参与花粉管萌发生长的蛋白质，只在雄蕊成熟花粉与花粉管中表达。 ④ PAL2基因： 编码PAL，参与花色素形成，只在花瓣中表达。 ⑤ Gy4基因： 编码大豆贮藏蛋白，只在胚乳组织中表达。