第五章核酸的结构.pptVIP

核酸（DNA和RNA）是线性多聚核苷酸， 基本结构单元是核苷酸 DNA与RNA结构相似，组成成份上略有不同 核酸的组成 胺式亚胺式互变异构 酮式烯醇式互变异构 （3）稀有碱基 嘌呤——次黄嘌呤、1-甲基次黄嘌呤、 N2、N2-二甲基鸟嘌呤。 嘧啶——5-甲基胞嘧啶、5-羟甲基胞嘧啶、 二氢尿嘧啶、4-巯尿嘧啶 都是基本碱基的化学修饰型 糖与碱基之间的C-N键：C-N糖苷键，且都是β糖苷键。 C1——N1（嘧啶） C1——N9（嘌呤） 碱基与糖环平面垂直。 （三） 核苷酸 核苷酸 八种核苷酸 M/单，D/二，T/三；P-磷酸 RNA的名称为单/二/三苷酸， DNA在单/二/三前加脱氧两字。 如AMP称腺苷一磷酸(或腺苷酸） dAMP称为脱氧腺苷一磷酸（脱氧腺苷酸） 稀有核苷酸与上类似 （四）核苷酸的衍生物 生物体内分布最广和最重要的一种核苷酸衍生物。 ATP的性质 是重要的能量转换中间体 ATP含两个高能磷酸键：水解时 可释放大量自由能，推动体内各种需能反应。 ATP也是磷酰化剂：磷酰化的底物具较高能量（活化分子），是许多生物化学反应的激活步骤。 (2)GTP (鸟嘌呤核糖核苷三磷酸) 生物体内游离存在，也是一种高能化合物 具有类似ATP的结构 主要是作为蛋白质合成中磷酰基供体 在许多情况下, ATP 和 GTP 可以相互转换 （3）cAMP 和 cGMP cAMP 3’,5’环腺嘌呤核苷一磷酸 cGMP 3’,5’-环鸟嘌呤核苷一磷酸 ——细胞间信使 cAMP 和 cGMP 的环状磷酯键是一个高能键：pH 7.4时水解能约为43.9 kJ /mol，比 ATP 水解能高得多。 DNA一级结构的简写形式 （二） RNA的一级结构 核糖核苷酸通过磷酸二酯键相连形成的长链 研究最多：tRNA、rRNA及一些小分子RNA。 1、tRNA分子特点： 约由73－93个核苷酸组成 分子中含有较多的修饰成分（10-20%） 3‘-末端都具有－CCA－OH的结构 5’-末端磷酸化，常为G（pC） ①5′末端帽子结构：m7GpppN ②3′末端有多聚腺苷酸尾巴结构(polyA) ③单顺反子（一条mRNA链上有一个编码区） Chargaff规则： （1）A=T （2）G=C （3）A+C=G+T （4）A+G=C+T DNA 一 股 的 核 苷 酸 序 列 与 另 一 股 的 序 列 互 补：A-T、G-C 大 部 分 DNA 所 具 有 的 双 螺 旋 结 构 ， 亦 称 为 B 型 真核细胞染色体的DNA念珠状三级结构 RNA中的碱基配对原则 A-U G-C tRNA的三叶草型二级结构 （1）两条反向平行的 多核苷酸链围绕 同一中心轴缠绕， 为右手螺旋。 1、结构特征 （2） 碱基位于双螺旋的内侧， 磷酸和核糖在外侧， 通过3’，5’－磷酸二酯键构成骨架。 碱基平面与纵轴垂直， 糖环平面与纵轴平行。 大沟：宽1.2nm，深0.85nm，小沟：宽0.6nm，深0.75nm。 （3）主要参数 双螺旋的直径为2nm， 碱基堆积距离为0.34nm， 两个核苷酸之间的夹角36°， 每圈螺旋含10个核苷酸，螺距3.4nm。 （4）两条核苷酸链依靠碱基间形成的氢键而结合。 A＝T G≡C （5）碱基在一条链上的排列顺序不受任何限制。但根据碱基配对原则，一条核苷酸链序列可决定另一条互补链的序列。 双螺旋的补充： （1）夹角和碱基对的数目变化 （2）碱基对沿长轴旋转一定的角度 ①碱基堆积力形成疏水环境（主要因素） 。 ②碱基配对的氢键。GC含量越多，越稳定。 ③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键，中和了磷酸基上的负电荷间的斥力，有助于DNA稳定。 ④碱基处于双螺旋内部的疏水环境中，可免受水溶性活性小分子的攻击。 2、稳定双螺旋结构的因素 3、DNA双螺旋结构的多样性 DNA的类型 类型 结晶状态 螺距 碱基距离 每圈 旋转 (nm) (nm) bp数 方向 A 相对湿度75% 2.8 0.256 11 右手 DNA钠盐 B 相对湿度92% 3.4 0.34 10 右手 DNA钠盐 C 相对湿度66% 3.1 0.332 9.3 右手 DNA锂盐 Z d(GCGCGC)