生物信息学数据库包其郁.pptVIP

第五节 数据库 1. 分子生物信息数据库发展简史 2．分子生物信息数据库分类 3．核酸序列数据库 4．蛋白质序列数据库 5．疾病相关基因数据库 一、分子生物信息数据库发展简史 60年代初， Dr. Margaret Oakley Dayhoff和她的同事们收集了所有当时已知的氨基酸序列，发表了《蛋白质序列及结构图谱》，建立了第一个生物信息数据库－－这一蛋白质数据库后来成为蛋白质信息资源PIR。 EMBL ：1982年，第一个DNA序列数据库在欧洲分子生物学实验室（EMBL）诞生。 GenBank：美国洛斯阿拉莫斯（Los Alamos）国家实验室建立了GenBank。1988年，美国组建了国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI。 DDBJ：日本的DNA数据库（ DDBJ ）于1984年在三岛市建成。 二、分子生物信息数据库分类 基于数据类型： 储存DNA、RNA、EST和蛋白质等 如NCBI中的UniGene数据库为DNA序列数据库。 根据物种类型： 储存该物种基因组中有关结构和功能基因组信息 人类基因组数据库（The GDB Human Genome Database）