RNA加工水平的调控.ppt

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三、 RNA加工水平的调控 RNA加工: 剪切 (cleavage) 修剪 (trimming) 剪接 (splicing) 修饰(modification) 戴帽” (capping) m7Gppp— “接尾” (tailing) PolyA. 编辑 (editing) RNAi 降解 (一)切除多余序列 1.??? 基因间序列的除去 2.??? 内元的除去 可变剪接(alternative splicing) 调控基因的表达,以适应生理的需求。可变剪切的结果,一个单基因转录得到的mRNA前体,可以产生多个蛋白质,即蛋白质同源体(isoform)。 (二)碱基修饰 差不多所有RNA都是含有不同数量的修饰成分,尤以tRNA和snRNA为最多。迄今RNA中的修饰成分发现已近百种,但对其功能的认识还不多。 (三)RNA编辑 1986年Berme等人从锥体虫中发现的一种新的RNA加工方式。当时发现锥体虫线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅱ(CoⅡ)基因与酵母或人的相应基因相比,在编码蛋白的170位氨基酸附近有一移码突变。比较锥体虫CoⅡ基因与其转录物的序列,发现转录序列在相应上述移码突变位点附近有四个不被基因DNA所编码的额外的尿苷酸,这四个尿苷酸正好校正了基因的移码突变。 480 490 500 510 mRNA: UUA GGU AUA AAA GUA GAU UGU AUA CCU GGU AGG UGU AAU 蛋白序列 :L G I K V D C I P G R C N DNA: TTA GGT ATA AAA GTA GA* * G* A* A CCTGGT AGG TGT AAT 核酸序号以mRNA起始密码AUG的A开始编号。下划线标出与人及酵母相应蛋白相同的氨基酸。 锥体虫T.buucei亚种mRNA的编辑(不是全部) mRNA 起始密码 编辑区域 5’区 编码区 3’及PolyA 区 CoⅡ +/- 4/0 CoШ -/? 394/18 32/1 Cyb + / + 34/0 14/0 MURF2 -/+ 26/4 斜线坐标时插右边表示删去U。斜线右表示基因中有无起始密码。右边表示编辑中有无构建起始密码。 Mechanism of edting RNA editing is catalyzed by a complex with seven major polypeptides, two of which correspond to distinct ligases. U deletion and U insertion involve gRNA-directed endonuclease cleavage of the pre-mRNA (shown by an arrowhead), either 3-U-exo or TUTase acting on the upstream fragment, and RNA ligase rejoining the mRNA. R, purine(s); Y, pyrimidine(s). These two forms of editing use distinct cleavage activities and distinct ligase enzymes, and the 3-U-exo is not a reverse TUTase reaction , which is indicated by the unequal sign. gRNAs have three main p

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