第六章核酸的化学.ppt

第一节 核酸通论 核酸的发展简史、种类与分布、生物功能 1944年Avery细菌转化实验 DNA是主要的遗传物质 (1):原核生物: 没有细胞核,它的DNA存在于一个叫“类核/拟核”的结构中。 在某些细菌具有以质粒形式存在的DNA。 质粒：plasmid,指染色体外基因，能自主复制，并给出附加的性状。 (2)：真核生物： 不同种的生物细胞的DNA含量相差很大，但同种生物细胞的DNA含量总是相同的； DNA在细胞核内呈高度卷曲的双股螺旋线性分子，与组蛋白结合形成染色体； 线粒体和叶绿体也含有DNA，但不与组蛋白结合，分子也较小。 (3)：原核生物染色体DNA，质粒DNA，真核生物细胞器DNA都是环状双链DNA；真核生物染色体是线形双链DNA，末端具有高度重复序列形成的端粒结构。 RNA在蛋白质的生物合成中起重要作用 “一个基因一条多肽链”是现代遗传学极重要的基本概念。基因功能的表达是以蛋白质的形式体现出来的。大量的实验证明：RNA在蛋白质生物合成中起着重要作用，即RNA的核心功能是：遗传信息由DNA到蛋白质的中间传递体。 常见核苷酸及其衍生物的形式、功能 常见（脱氧）核苷酸的结构和命名 腺苷酸及其多磷酸化合物 2.环化磷酸化 NAD、NADP、FAD、HSCoA 碱基、核苷、核苷酸的概念和关系 核酸的共价结构 核酸中核苷酸的连接方式 DNA的一级结构 RNA的一级结构 DNA一级结构的概念、特点与意义： DNA分子一级结构特点 A:DNA是没有分支的多核苷酸长链，各脱氧核苷酸之间以3′5′—磷酸二酯键相连 B：相间排列的戊糖和磷酸构成脱氧核糖核酸大分子的主链，而其碱基则可看成是侧链基团； C:天然DNA分子长链的两端，总是有一个核糖带有自由的5′-磷酸，而另一端的核糖带有自由的3′-OH。DNA的方向就是从5′端到3′端； D:DNA分子的核糖的2′位上没有自由羟基,这是DNA作为主要遗传物质极其稳定的根本原因.特别是对于碱的抵抗力. DNA分子一级结构的意义: 不仅在于它的碱基排列以密码子的方式蕴藏了遗传信息,而且还决定了DNA的二级结构和空间结构。生物界物种的多样性即寓于DNA分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。 RNA的一级结构: DNA的高级结构 DNA碱基组成的Chargaff定则 DNA的二级结构 DNA的三级结构 DNA与蛋白质复合物的结构 ——染色体 Chargaff定则 Watson 和 Crick 于1953年提出了DNA双螺旋结构模型，说明了DNA 的二级结构。（即B型DNA） （3）碱基对：由于双螺旋结构要求有一个正常的螺旋形式，就必须按碱基互补的原则进行碱基配对；嘌呤环和嘧啶环上的氨基和酮基是亲水的，配对的碱基之间能够形成氢键；而嘌呤环和嘧啶环本身都是疏水的，因而同一条链中的相邻碱基能够形成一种堆积力；这两种力的协同作用就维持了双螺旋结构的稳定性 (4)大沟小沟:两条主链和碱基并不充满双螺旋的空间,其表面形成两条凹槽,一条宽而深为大沟；一条狭而浅为小沟。特别是大沟,对于Pr识别DNA双螺旋结构上的特定信息是非常重要的。因为只有在沟内，Pr才能“感觉”到不同碱基顺序，而在双螺旋的表面全是相同的磷酸和脱氧核糖的骨架，是没有什么信息可言的 DNA的双螺旋结构稳定因素 氢键:在每一个碱基上都有适于形成氢键的供氢体如氨基和羟基以及受氢体如酮基和亚氨基，在形成氢键时，要求供体氢原子与受体原子具有互补性即特异性很强；氢键的另一个特点是具有高度的方向性，如果供体原子，氢原子和受体原子三者在一条直线上，形成的氢键最强。同链的相邻碱基之间的堆积力恰恰为形成最强的氢键提供了条件。 碱基堆积力：同一条链中相邻碱基之间的非特异性作用力，即疏水作用和范德华力。嘌呤环和嘧啶环本身带有一定程度的疏水性，这些不溶性的环状物相互联合，则可以使有序的水分子壳层减少到很低的数量。因此，DNA相邻碱基就有相互堆积在一起的趋势；其次是DNA链中的大量的嘌呤环和嘧啶环，其累积的范德华力是相当可观的，是构成碱基堆积力的另一个重要因素。 双链DNA中的碱基比单链DNA中的碱基堆积程度更高，这是由两条链的配对碱基之间的氢键所引起的。很明显，已被氢键定向的碱基更容易堆积；相应地，已经堆积的碱基更容易氢键键合。因此，两种作用力相互协同，形成一种非常稳定的结构。如果一种作用力被消除，则另一种作用力大为削弱。 负电荷的磷酸基的静电斥力被屏蔽：每一个核苷酸的磷酸基上都带有一个负电荷，如没被中和，强有力的静电排斥作用将驱使两条链分开。但是带负电荷的磷酸基团可以被生理环境中的组蛋白或正离子所中和，即正离子围绕在磷酸基团周围形成了“离子云”，有效地屏蔽了磷酸基团之间的静电斥力