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ATCase ATP + ATCase(天冬氨酸转氨甲酰酶)所催化的反应 氨甲酰磷酸 天冬氨酸 CTP - UTP UMP 氨甲酰天冬氨酸 E.coli的ATCase的亚基排列 催化(C)亚基(catalytic subunit) 调节(R)亚基( regulative subunit) ATCase变构效应的动力学特征 ATP(正效应剂) CTP(负效应剂) 低催化活性构象 T(tense) - 态 C C C C C C R R R R R R C C C C C C 高催化活性构象 R(relax) -态 R R R R R R Vmax 1/2Vmax Km 8、Ribozyme 核酶 Ribozyme是一种RNA生物催化剂 Ribozyme的发现:RNA具有酶的催化功能是由Cech T.R于1982年提出的。1981年,发现四膜虫(tetrahymena thermophila)的26S rRNA前体在成熟过程中,其居间序列通过剪接反应被除去。并证明四膜虫rRNA前体的居间序列核糖核酸(L-19RNA)具有多种催化功能,将这种具有催化活性的RNA称为 Ribozyme (ribonucleic acid enzyme)。获得1989年诺贝尔化学奖。 rRNA基因的转录产物即rRNA前体(大约6400个核苷酸残基)很不稳定,在鸟苷和Mg2+存在下切除自身的内含子(intron或intervening sequence,IVS-居间序列或间插序列),使两个外显子(exon)拼接起来,形成成熟的rRNA_——此过程没有任何蛋白质酶参与,称为自我剪接(self-splicing),并证明RNA具有催化活性。 四膜虫rRNA成熟中RNA的剪接示意图 Ribozyme在一定条件下,高度专一地催化下列反应,具有相应酶的活性(底物专一、符合米氏方程、对竞争性抑制剂敏感) 1.核苷酸转移酶活性 2CpCpCpCpC?CpCpCpCpCpC+CpCpCpC 2.磷酸二酯酶活性 CpCpCpCpC ?CpCpCpC+Cp 3.磷酸转移酶活性 CpCpCpCpCpCp+UpCpU ?CpCpCpCpCpC +UpCpUp 4.RNA限制性内切酶活性 另外,1997年,Zhang和Cech证明了人工合成的RNA分子具有肽基转移酶活性。 Ribozyme发现的重大意义: RNA具有酶的催化活性,向酶的化学本质是蛋白质这一传统概念提出了挑战。 在理论上,对于生物起源和生命进化的研究具有重要启示。 生物催化分子进化的可能性: RNA RNA-蛋白质 蛋白质-RNA 蛋白质-辅酶或辅基 蛋白质 在实践上,由于Ribozyme的内切酶活性,可定点切割mRNA,破坏mRNA,抑制基因表达,为基因、病毒和肿瘤治疗提供了可行途径。 酶与底物的中间络合物学说(Henri和Wurtz) 两个假设: E与S形成ES复合物的反应是快速平衡反应,而ES分解为E及P的反应为慢反应,反应速度取决于慢反应即 V=k3[ES]。 S的总浓度远远大于E的总浓度,因此在反应的初始阶段,S的浓度可认为不变即[S]=[St]。 E + S k1 k2 k3 ES E + P 中间产物 抑制作用的机制: 6. 抑制剂对酶反应速度的影响 1.抑制剂与酶结合成极稳定的络合物,从而减低或破坏酶的活性。 2.破坏酶或辅基的活性基团或改变活性部位的构象。如重金属Ag+、Hg2+和类金属As3+破坏SH 3.夺取酶与底物结合的机会,从而减少酶的作用。(竞争性抑制剂) 4.阻抑 反应的顺利进行(反馈抑制) S + E ES E + P Vmax的意义 Vmax是酶完全被底物饱和时的反应速度,与酶浓度成正比。 Vmax=K3 [E],如果酶的总浓度已知,可从Vmax计算酶的转换数,即动力学常数K3。 酶的转换数(turnover number):当酶被底物充分饱和时,单位时间内每个酶分子催化底物转变为产物的分子数。 酶的转换数可用来比较每单位酶的催化能力 1.需要金属的酶分类: (1)金属酶-metalloenzyme:含紧密结合的金属离子。如Fe2+、Fe3+、Cu2+、Zn2+、Mn2+ (2)金属-激活酶(metal-activated enzyme):含松散结合的金属离子,如Na+ K+ Mg2+ Ca2+ 2.金属离子的作用: 许多氧化-还原酶中都含有铜或铁离子,它们作为酶的辅助因子起着传递电子的功能。 许多激酶的底物为ATP-Mg2+复合物。 金属离子通过水的离子
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