海岛棉5个CBF-DREB基因的克隆与表达分析.pdfVIP

棉 花 学 报 Cotton Science 20 16袁28 渊1冤院42―51 岛棉5 个 基因的克隆与表达分析 李月 代培红 刘超 苏秀娟 孔丽颖 李翔 才运 刘晓东* 疆农业大学农学院/ 农业生物技术重点实验室袁 疆乌鲁木齐830052 冤 摘要院低温尧干旱和盐渍是影响作物生长尧产量和全球地理分布的重要非生物胁迫遥 CBF/DREB 转录因子是参 与植物非生物胁迫应答反应的重要调控蛋白遥 为了更好地了解棉花 家族基因袁通过生物信息学的方法袁 从海岛棉中克隆了5 个具有完整开放阅读框的 基因袁命名为 5遥 这5 个基因编码的蛋 白与其他植物冷胁迫相关的CBF 蛋白具有高度的保守性袁含有1 个AP2 功能结构域和2 个特征基序遥系统进 化树分析表明袁这5 个基因与拟南芥的3 个参与冷胁迫的 基因一起聚类在DREB 亚家族中的A-1 亚组遥 通过RT-PCR 的方法分析了海岛棉基因 1―5 在高盐 200 mmol 窑L 1 NaCl冤尧干旱尧4 ℃低温等非生物胁 迫处理下的表达模式遥 结果表明 中2 个基因在冷胁迫下上调表达袁5 个基因在干旱和盐处理下均下调表达遥 这些为进一步探索 基因在棉花逆境胁迫应激反应中的作用提供了有价值的信息遥 关键词院棉花曰海岛棉曰CBF/DREB 转录因子曰基因克隆曰基因表达调控曰冷胁迫 中图分类号院S562.035.3 文献标志码院A 文章编号院1002-7807(2016)01-0042-10 10.11963/issn.1002-7807.201601006 Li Yue, Dai Peihong, Liu Chao, Su Xiujuan, Kong Liying, Li Xiang, Li Caiyun, Liu Xiaodong* ( 830052, ) Low temperature, drought, and salinity are maj or abiotic stresses that influence the survival, productivity, and geo- graphical distribution of many important crops worldwide. The C-repeat/dehydration-responsive element binding transcription factors(CBF/DREB) are important proteins involved in the response to plant abiotic stresses. To better understand genes, we identified five from island cotton( L.) using abioinformatics approach. These genes ( 1- 5) were shown to encode proteins that share a high similarity with plant cold stress-related CBF proteins, which contain the classic AP2 domain and two CBF signature sequences. Phylogenetic analysis revealed that the isolated cotton genes could be classified into the A-1 subgroup of the DREB subfamily with 1-3 genes in . Semi-quantitative reverse transcription PCR was used for th