植物生长建模——数字农业的核心与关键技术.pdf

“2003 年数字农业与农村信息化发展战略研讨会”书面发言 （2003 年 3 月 24 日，北京） 植物生长建模 —— 数字农业的核心与关键技术 胡 包 钢 hubg@ ( 中国科学院自动化研究所, 中法联合实验室-LIAMA 北京 100080) 中国古人关于“民以食为天”的说法再恰当不过地表明了人类对于生存提出的最基 本要求。由此，我冒昧地延伸一步：“食以植为根”。用通俗的语言可以解释为“植物 是食物链中最为根本的单元”。 植物不仅为人类所直接食用，它也是动物赖以生存的 必要条件。人类正是通过食用动物这样间接的方式来消耗植物。植物的作用远远大于 仅为人类的食品。绿色植物除了保持水土、维护生态平衡的重要作用外，还能够为人 类提供新鲜空气，纯净水质，宜人气候，优雅环境。人们的许多穿着、起居、药品是 离不开植物的。可以毫不夸张地说“植物是大自然恩赐于人类最珍贵的礼物”[1]。 在本次由中国科学技术部主持的“2003 年数字农业与农村信息化发展战略研讨会” 中，我愿意就“植物生长建模”研究谈一些个人的看法。希望通过“植物”与“建模” 这样两个关键词分别扣住“农业”与“数字”组合出来的重要主题。在此将感谢各行 领域专家对本文的兴趣并提出指正意见。 1．什么是植物生长建模？ 所谓“植物生长建模”就是以植物体为研究对象，通过构造一个简单但是能够反映 物理世界中真实植物的数学抽象描述模型，模拟被研究对象的发生、发展过程，为解 释现象，揭示机理，发现规律，预测结果提供有用工具[1]。我们将建立这样一个计算 机模型的过程或方法简称为“建模”。在此应该对“植物生长建模（Plant growth modeling ）”一词有广义的理解，它可以被扩展为包括模拟(Simulation) 与可视化 (Visualization)部分。 可视化仿真为植物生长研究提供了一种直观、迅捷的科学研究方法。它可以帮助研 究者通过图形方式更有效地观察与分析植物生长中的结构与功能、生长发育、进化、 分布等各种规律和影响因素，以便系统的研究，并加快模型反馈和验证工作。更为重 要的是，可视化三维建模为研究与探索“植物－植物”，“植物－环境”或“人工操作 －植物”交互关系提供了独到的方法与途径。这主要是由于植物的形态结构在植物生 长过程中起着十分重要的作用。借助可视化模型研究植物生长的典型实例包括：植物 冠层光强分布、光合作用产量、趋光效果；水分蒸腾； 种植间距；作物与杂草竞争； 植物体的变形、弯曲、及倒伏； 植物相互间、或与外界障碍物之间产生的根系或冠体 碰撞等问题。同时，植物生产过程中的人工干预也将涉及到三维可视化仿真研究，如 人工修剪、整形等栽培操作下的植物生长过程模拟；施喷化肥、农药、水等人工管理 下的效果模拟[1] 。国内外学者有时将这样一个研究工作称为“虚拟植物(Virtual plant)”[2,3] 。 文[1-3]对国际、国内有关植物生长建模的发展状况及未来展望作出了一定的介绍， 并给出了相关国内外参考文献。 2． 植物生长建模的科学内涵 植物作为“数字农业”发展中的应用对象之一，其建模基础涉及了众多学科领域， 其中包括生物学、植物学、农学、生态学、信息科学、应用数学等。植物生长建模大 致可以被认为属于应用基础研究的范畴，它主要是宏观层次上的研究。不过在农业应 用中通常是小到植物器官，大到作物群体，有时会涉及到从微观层次的建模，如基因、 分子、细胞等。植物生长建模研究可以纳入所谓“生物信息学（Bio-informatics ）”这 样一个新兴的交叉科学领域之中。 下面试举一些在植物生长建模中的科学或应用方面的具体问题： A ． 形态发生模型：这里包括植物的基因与拓扑结构模型及几何形态模型。 B ． 生理生态模型：这里包括大量局部内容的子模型，如光和作用、水肥效果、呼吸 功能、温度影响、生物量生成与分配、矿质营养、大气等。 C ． 描述植物生命过程的数学模型方法研究。其该过程表现的问题形式为：a. 众多的 控制变量及影响因素；b. 各变量与生长结果之间可能具有较强的动态耦合变化过 程；c. 生长过程呈现随机性、非线性、多