TCGA癌症数库介绍专题.pptVIP

TCGA数据库介绍专题 上海尔云-云生信团队 2015.9.20 / 1. 前言 2. 数据产生历程 5. 目前已有的癌症种类 3. barcode 4. Data types and data levels 6. 数据下载解读 目录 前言 01 / TCGA- the Cancer genome ATLAS cancer Genome Transcriptome Clinic Epigenome Proteome 癌症种类丰富，样本量大 34 kinds of cancer 325 samples on average / 数据产生历程 02 / TCGA数据的产生历程： 1. 组织样本和临床数据来源网站(TSS)收集的数据发送到Biospecimen核心资源(BCRs)。 2. BCRs提交临床数据和元数据到数据协调中心(DCC)和测序中心(GSCs),获取组织变异数据,然后提交给DCC。 3. GSCs提交跟踪文件,序列比对后文件到癌症基因组学中心(CGHub)。 4. 提交给DCC和CGHub的数据可供研究团队和基因组数据分析中心(GDACs)使用。 5. 分析pipeline以及由GDACs产生的数据结果通过DCC保存到研究社区（community）中。 /abouttcga/overview barcode解读 03 / 详细请见：/display/TCGA/T