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南 京 理 工 大 学 紫 金 学 院 毕业设计(论文)外文资料翻译 系： 计算机 专 业： 计算机科学与技术 姓 名： 沈俊男 学 号： 060601239 (用外文写)外文出处： E. Jimenez-Ruiz,R. Berlanga. The Management and Integration of Biomedical[M/OL]. Castellon：Spanish Ministry of Education and Science project,2004[2005-09098]. (用外文写) /ftp/cs/papers/0609/0609144.pdf 附 件： 1.外文资料翻译译文；2.外文原文。 指导教师评语： 签名： 年 月 日 注：请将该封面与附件装订成册。 附件1：外文资料翻译译文 管理和集成的生物医学知识: 应用于Health-e-Child项目 摘要：这个Health-e-Child项目的目的是为欧洲儿科学发展集成保健平台。为了实现一个关于儿童健康的综合观点,一个复杂的生物医学数据、信息和知识的整合是必需的。本体论将用于正式定义这个领域的专业知识，将塑造医学知识管理系统的基础。文中介绍了一种对生物医学知识的垂直整合的新颖的方法。该方法将会主要使临床医生中心化，并使定义本体碎片成为可能，连接这些碎片（语义桥接器），丰富了本体碎片（观点）。这个策略为规格和捕获的碎片，桥接器和观点概述了初步的例子证明从医院数据库、生物医学本体、生物医学公共数据库的生物医学信息的征收。 关键词：垂直的知识集成、近似查询、本体观点、语义桥接器 1．1 医学数据集成问题 数据来源的集成已经在数据库社区成为传统的研究课题。一个综合数据库系统主要的目标是允许用户均匀的访问一个分布和一个异构数据库。数据集成的关键因素是定义一个全局性的模式，但是值得指出的是，我们必须区分三种全局模式：数据库模式、概念模式和域本体模式。首先介绍了数据类型的信息存储、本地查询；其二，概括了这些图式采用更富有表达力的数据模型，如统一建模语言(UML)（TAMBIS和SEMEDA都遵循这个模式)。最后，领域本体的概念及性质描述涉及领域(如生物医学)独立于任何数据模型，促进应用程序语义的表达(例如，通过语义标注)以及推理。 医学研究在统一名词术语的概念和分类方面具有悠久历史(比如通过全国统一的医学的语言系统(UMLS))，而且在医疗信息系统中也用本体代表和查询。 最近，几种结合医疗技术和生物信息学的公共数据库已经以本体为基础(例如ONTOFUSION)。然而，当引进的领域本体整合资讯来源时，新的问题和挑战出现了。首先，许多在生物医学领域本体不完全包括具体应用的要求。而且，这些概念可以包含不同的抽象级别(例如分子、器官、疾病等)，可以在相同或不同的领域本体中出现。其次，域本体通常相当大，这导致两个主要的结果:用户发现他们难以使用用于处理和查询的信息来源，只有一个子集中的信息来源用的是系统中的应用。最后，在当前集成的方法中，对于域来讲，手工操作现有的数据来源是必要的，这意味着一个大的分布场景的瓶颈的存在。 本文主要论述前面两个问题:管理多个域本体和展示用户终端个性化的本体观念和相关应用于一体的综合性生物医学信息系统。该方法包括一个新的基于本体的方法论，横跨整个一体化的进程。这个方法既靠基于本体的定义又依赖于其基于本体碎片的构造。 2 关于垂直的知识集成的方法 孩子健康调查项目最重要的方面，与当前生物集成项目相反，整合病人资料根据疾病模型，代替整合公共医学资料库。综合疾病知识模型是以一种解的概念来指定特定疾病,考虑到所有的生物医学的抽象层。病人中心收集的资料，为医院的某一特定的综合疾病知识模型条款加上语义标注。以下描述逻辑的术语，分布库，存储病人，语义标注被称为ABoxes盒。 这里介绍的方法，为从知名生物本体和公共数据库中建立综合疾病知识模型提供了必要的机制。最简单的说，它使得建筑本体视图的碎片一致，这是相互医学本体的所谓的语义的桥梁。每一个本体碎片的目的是捕捉到参与了对某一特定疾病的基因的主要概念，抽象层(例如风琴等)。这个桥梁与指定的元素的抽象层进行了实际的垂直整合。用这个方法可以发现，桥梁的生物医学领域有明确本体（例如：国家癌