碱基、密码子进化、突变稳定性.pptVIP

碱基、密码子进化、突变稳定性 一、碱基为什么是四个字母？ 从信息的角度考虑 1. 假设碱基数种类为N，序列长度为n，此序列的 信息量为： 2. 若该序列出现的概率表示为p(n, N)，则平 均信息量： 3. 序列的平均长度： 4. 信息量的极大化 利用拉格朗日未定乘子法： 化简可得： 转换突变： 嘌呤与嘌呤之间 或 嘧啶与嘧啶之间 颠换突变： 嘌呤与嘧啶之间 自对的突变率很小，例如A-A 2. 突变频率为： 这里K是一个密码字内碱基数目，a、b分别是转换和颠换突变常数。 3. 若氨基酸的数目为L，给定L下的突变率M： 讨论 1. N=4的稳定性是最高的，N=6次稳定。 2. 当L≤36，6种碱基的二联体（K=2）作为 密码子来编码氨基酸，稳定性也相当高。 3. 实验已发现某些类嘌呤和类嘧啶物质也可 构成碱基对，因此这种密码系统需要注 意。 4. 或者进化从原有基础上(N=4, K=3)扩展为 (N=6, K=3)，即保持三联体编码的道路。 二、遗传密码的简并规则 遗传密码的极高普适性和内在单纯性说明了密码表的构成遵循一定的逻辑。 我们试图从进化稳定性的角度说明现有密码表的结构，即讨论每一氨基酸和终止密码在密码表上的排布： 1. 每一多重态